کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
6296620 | 1617434 | 2015 | 7 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
A comparison between functional frequency and metabolic flows framed by biogeochemical cycles in metagenomes: The case of “El Coquito” hot spring located at Colombia's national Nevados park
ترجمه فارسی عنوان
مقایسه ای بین فرکانس عملکردی و جریان های متابولیک که توسط چرخه های بیوگرافی شیمیایی در متان ژن ها صورت می گیرد: مورد الکویتو ؟؟ بهار گرم در پارک ملی نابود کلمبیا واقع شده است
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
ترجمه چکیده
مطالعه نمونه های متیل ژنومیک برای درک جوامع میکروبی در اکوسیستم ها ضروری است. در این مطالعه، نمونه های ژنومی از یک کوکویتا ؟؟ به منظور بررسی رابطه بین قابلیت عملکرد متابولیکی و توزیع جریان متابولیک با توجه به محدودیت های ترمودینامیکی و چرخه های بیوگرافی شیمیایی از طریق تجزیه و تحلیل تعادل شار مورد بررسی قرار گرفت. عملکرد متابولیک متفقین با اختصاص واکنش ها و آنزیم ها به مسیرهای متابولیک ایجاد شد. از یک طرف، ما دریافتیم که گروه های متابولیک مربوطه با توجه به عملکرد هدف اکوسیستم از مقدار دیدگاه های واکنش های متابولیکی متفاوت است. از سوی دیگر، از نظر سهم کل نقطه جریان متابولیک، به نظر می رسد که پلاستیکی توزیع متابولیسم حفظ شود، زیرا چندین گروه مشترک وجود دارد که به طور قابل توجهی در کل جریان متابولیسم سیستم وجود دارد. با این وجود، این پلاستیسیته برای تمام توابع هدف با توجه به تفاوت بین نیتروژن و بقیه دوره ها حفظ نمی شود، به وضوح نشان می دهد که قابلیت انطباق میکروبی به اکوسیستم در توزیع جریان متابولیسم به جای فرکانس ظاهر شدن از واکنش های مشابه.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم کشاورزی و بیولوژیک
بوم شناسی، تکامل، رفتار و سامانه شناسی
چکیده انگلیسی
The study of metagenomic samples is crucial for understanding microbial communities in ecosystems. In this study, genomic samples of the “El Coquito” acidic hot spring, located at the Nevados Natural National Park in Colombia, were analysed to evaluate the relationship between its metabolic functionality, and metabolic flows distribution considering the thermodynamic restrictions and the biogeochemical cycles through a flux balance analysis. The metabolic functionality of the metagenome was established by assigning reactions and enzymes to the metabolic routes. On one hand, we found that relevant metabolic groups contribute in a different fashion depending on the objective function of the ecosystem from the amount of metabolic reactions perspective. On the other hand, from the contribution to the total metabolic flow point of view, it seems the metabolic distribution plasticity conserves, as there exists several common groups that significantly contribute to the total metabolic flux of the system. Nevertheless, this plasticity is not maintained for all objective functions due to the differences between the nitrogen and the rest of the cycles, clearly demonstrating that the microbial adaptation capability to the ecosystem is materialized in the distribution of the metabolic flows instead of the frequency of appearance of the same reactions.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Ecological Modelling - Volume 313, 10 October 2015, Pages 259-265
Journal: Ecological Modelling - Volume 313, 10 October 2015, Pages 259-265
نویسندگان
Maria A. Zamora, Andres Pinzón, Maria M. Zambrano, Silvia Restrepo, Linda J. Broadbelt, Matthew Moura, Johana Husserl Orjuela, Andrés F. González Barrios,