کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
6487583 | 42451 | 2016 | 9 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Next-generation proteomics faces new challenges in environmental biotechnology
ترجمه فارسی عنوان
نسل بعدی پروتئومیکها با چالش های جدید در بیوتکنولوژی زیست محیطی مواجه است
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
ترجمه چکیده
بیوتکنولوژی زیست محیطی به بررسی سیستم های جدید بیولوژیکی و درک کامل مکانیزم های مولکولی پایه متکی است. نسل بعدی پروتئومیکس بر اساس آخرین نسل از آنالیزورهای توده ای در حال حاضر اجازه می دهد ضبط پروتئام های کامل از هر میکرو ارگانیسم. تفسیر این داده ها اگر ژنوم ارگانیسم برقرار شود، می تواند ساده باشد، یا اگر از توالی پیشنهادی می توان به دست آورد، نسبتا آسان است از طریق روش های پروتروژنومیک انجام شود. با این حال نسل بعدی پروتئومیک ها با چالش های جدید و جالب مواجه می شوند زمانی که ارگانیسم به طور دوردست مربوط به ارگانیسم هایی است که قبلا مشخص شده است و یا زمانی که ترکیبات ارگانیسم ها باید تجزیه و تحلیل شوند. طیف سنجهای جرمی جدید و ابزارهای نوآورانه بیوانفورماتیک، امکان تغییر پروتئومیک، پروتئوموزومیک و متاپرستومیک را برای توصیف سیستمهای بیولوژیکی را تغییر شکل میدهند. استراتژی های غربالگری موقت و مقرون به صرفه نیز با این روش امکان پذیر است، همانطور که در کل پروتئومیک پروتئوم و پروتئومیک های زیر جمعیت وجود دارد. پیچیدگی نمونه های زیست محیطی به تحولات منحصر به فرد رویکردها و مفاهیم اجازه می دهد.
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی شیمی
بیو مهندسی (مهندسی زیستی)
چکیده انگلیسی
Environmental biotechnology relies on the exploration of novel biological systems and a thorough understanding of the underlying molecular mechanisms. Next-generation proteomics based on the latest generation of mass analyzers currently allows the recording of complete proteomes from any microorganism. Interpreting these data can be straightforward if the genome of the organism is established, or relatively easy to perform through proteogenomics approaches if a draft sequence can be obtained. However, next-generation proteomics faces new, interesting challenges when the organism is distantly related to previously characterized organisms or when mixtures of organisms have to be analyzed. New mass spectrometers and innovative bioinformatics tools are reshaping the possibilities of homology-based proteomics, proteogenomics, and metaproteomics for the characterization of biological systems. Novel time- and cost-effective screening strategies are also possible with this methodology, as exemplified by whole proteome thermal profiling and subpopulation proteomics. The complexity of environmental samples allows for unique developments of approaches and concepts.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Current Opinion in Biotechnology - Volume 38, April 2016, Pages 174-182
Journal: Current Opinion in Biotechnology - Volume 38, April 2016, Pages 174-182
نویسندگان
Jean Armengaud,