کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
6591935 456882 2013 8 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Experimental design of systems involving multiple fluorescent protein reporters
ترجمه فارسی عنوان
طراحی تجربی از سیستم های گزارش دهندگان پروتئین های مختلف فلورسنت
کلمات کلیدی
ترجمه چکیده
پروتئین های فلورسنت کاربرد گسترده ای برای تجزیه و تحلیل سیستم های بیولوژیکی پیدا کرده اند زیرا می توان آنها را برای ردیابی وقایع مختلف در سلول های زنده مورد استفاده قرار داد. پروتئین های مختلف فلورسنت نیز به طور همزمان برای نظارت بر جنبه های مختلف سیستم های بیولوژیکی مورد استفاده قرار می گیرند. با این حال، همپوشانی گسترده ای در طیف های انتشار پروتئین های فلورسنت، چالش هایی را در استخراج سهم پروتئین های فردی به اندازه گیری شدت فلورسانس به دست می دهد. این کار با در نظر گرفتن یک فرمول محاسباتی برای استخراج سهم شدت فلورسانس خبرنگاران فردی به اندازه گیری های کلی با استفاده از یک خواننده صفحه، به این مسئله می پردازد. سپس، این فرمول بندی برای به دست آوردن یک معیار طراحی تجربی برای انتخاب مجموعه ای از پروتئین های فلورسنت استفاده می شود به طوری که دقت سهم تخمین شده از پروتئین های فلورسنت مختلف به حداکثر می رسد. نتایج به دست آمده با استفاده از دو مجموعه داده های تجربی شامل مجموعه های مختلف پروتئین های فلورسنت معتبر می باشد. این کار نشان دهنده اولین مطالعه کمی است که طراحی آزمایشی را برای انتخاب پروتئین های فلورسنت مورد بررسی قرار می دهد تا به طور همزمان برای برنامه های چند منظوره استفاده شود.
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه مهندسی شیمی مهندسی شیمی (عمومی)
چکیده انگلیسی
Fluorescent proteins have found widespread applications for analysis of biological systems as they can be used to track various events within living cells. Multiple fluorescent proteins are also simultaneously used to monitor different aspects of biological systems. However, extensive overlap in the emission spectra of the fluorescent proteins poses challenges in extracting the contribution of individual proteins to overall fluorescence intensity measurements. This work addresses this issue by deriving a computational formulation for extracting the contribution of fluorescence intensities of individual reporters to the overall measurements taken using a plate reader. Then, this formulation is used for deriving an experimental design criterion for choosing sets of fluorescent proteins such that the accuracy of the estimated contribution of different fluorescent proteins is maximized. The results are validated using two sets of experimental data involving different sets of fluorescent proteins. This work represents the first quantitative study that evaluates experimental design for selection of fluorescent proteins to use simultaneously for multiple-labeling applications.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Chemical Engineering Science - Volume 101, 20 September 2013, Pages 191-198
نویسندگان
, , , , ,