کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
6874271 | 686948 | 2015 | 5 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Longest common substrings with k mismatches
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی کامپیوتر
نظریه محاسباتی و ریاضیات
پیش نمایش صفحه اول مقاله

چکیده انگلیسی
The longest common substring with k-mismatches problem is to find, given two strings S1 and S2, a longest substring A1 of S1 and A2 of S2 such that the Hamming distance between A1 and A2 is â¤k. We introduce a practical O(nm) time and O(1) space solution for this problem, where n and m are the lengths of S1 and S2, respectively. This algorithm can also be used to compute the matching statistics with k-mismatches of S1 and S2 in O(nm) time and O(m) space. Moreover, we also present a theoretical solution for the k=1 case which runs in O(nlogâ¡m) time, assuming mâ¤n, and uses O(m) space, improving over the existing O(nm) time and O(m) space bound of Babenko and Starikovskaya [1].
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Information Processing Letters - Volume 115, Issues 6â8, JuneâAugust 2015, Pages 643-647
Journal: Information Processing Letters - Volume 115, Issues 6â8, JuneâAugust 2015, Pages 643-647
نویسندگان
Tomas Flouri, Emanuele Giaquinta, Kassian Kobert, Esko Ukkonen,