کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
6929649 867528 2016 23 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Mathematical analysis and calculation of molecular surfaces
ترجمه فارسی عنوان
تجزیه و تحلیل ریاضی و محاسبه سطوح مولکولی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه مهندسی کامپیوتر نرم افزارهای علوم کامپیوتر
چکیده انگلیسی
In this article we derive a complete characterization of the Solvent Excluded Surface (SES) for molecular systems including a complete characterization of singularities of the surface. The theory is based on an implicit representation of the SES, which, in turn, is based on the signed distance function to the Solvent Accessible Surface (SAS). All proofs are constructive so that the theory allows for efficient algorithms in order to compute the area of the SES and the volume of the SES-cavity, or to visualize the surface. Further, we propose to refine the notion of SAS and SES in order to take inner holes in a solute molecule into account or not.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Computational Physics - Volume 322, 1 October 2016, Pages 760-782
نویسندگان
, ,