کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
6932992 | 867589 | 2014 | 25 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Accuracy and efficiency in computing electrostatic potential for an ion channel model in layered dielectric/electrolyte media
ترجمه فارسی عنوان
دقت و کارایی در محاسبه پتانسیل الکترواستاتیک برای یک مدل کانال یونی در رسانه دی الکتریک / الکترولیت لایه ای
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
پواسون معادله بولتزمن، الکترولیت لایه و دی الکتریک، روش شارژ تصویر کانال های یونی مدل توجیهی / ترکیبی ترکیبی صریح و ضمنی،
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی کامپیوتر
نرم افزارهای علوم کامپیوتر
چکیده انگلیسی
This paper will investigate the numerical accuracy and efficiency in computing the electrostatic potential for a finite-height cylinder, used in an explicit/implicit hybrid solvation model for ion channel and embedded in a layered dielectric/electrolyte medium representing a biological membrane and ionic solvents. A charge locating inside the cylinder cavity, where ion channel proteins and ions are given explicit atomistic representations, will be influenced by the polarization field of the surrounding implicit dielectric/electrolyte medium. Two numerical techniques, a specially designed boundary integral equation method and an image charge method, will be investigated and compared in terms of accuracy and efficiency for computing the electrostatic potential. The boundary integral equation method based on the three-dimensional layered Greenʼs functions provides a highly accurate solution suitable for producing a benchmark reference solution, while the image charge method is found to give reasonable accuracy and highly efficient and viable to use the fast multipole method for interactions of a large number of charges in the atomistic region of the hybrid solvation model.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Computational Physics - Volume 259, 15 February 2014, Pages 488-512
Journal: Journal of Computational Physics - Volume 259, 15 February 2014, Pages 488-512
نویسندگان
Huimin Lin, Huazhong Tang, Wei Cai,