کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
8145185 1524066 2018 15 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
A spatiotemporal master equation model of morphogen transport: Local accumulation times, noise measurement and diffusion force
ترجمه فارسی عنوان
یک مدل معادلات استاد فضایی از انتقال مورفوژن: زمان انباشت محلی، اندازه گیری نویز و نیروی انتشار
کلمات کلیدی
شیب مورفوژن، معادله استاد زمان تجمع محلی،
ترجمه چکیده
مورفوژن، یک کلاس مولکول های سیگنالینگ جهت هدایت و کنترل شکل گیری الگوی سلولی و بافت، ابتدا در یک منطقه محلی سنتز شده و سپس به مناطق دیگر منتقل می شود و یا تجزیه می شود. در مطالعات قبلی، این فرایند حمل و نقل مدل های جبرانی معادلات دیفرانسیل معمولی مدل شده است. با این حال، در محیط میکروکوسنیک، این فرآیند اغلب با نوسانات تصادفی (یا سر و صدا) تحت تاثیر قرار می گیرد. هنوز معلوم نیست چگونه این نویز بر روی شیب مورفوژن تاثیر می گذارد. در اینجا ما یک مدل معادلات استاد فضایی برای بارگذاری فرآیند انتقال مورفوژن در یک زمینه توسعه محدود ایجاد می کنیم که از آن می توان معادلات لحظه ای معادله ی اول معادله ی اصلی را بدست آورد. ما بیان تحلیلی زمان انباشت محلی را به دست می آوریم که مورفوژن ها به حالت پایدار می رسند و می بینیم که این زمان با توجه به موقعیت های سلولی غیر خطی است. ما همچنین عبارات تقریبی واریانس حالت پایدار، عوامل فانو و زمان انباشت محلی واریانس را به دست می آوریم. جالب توجه است، ما دریافتیم که زمان انباشت محلی برای واریانس تعداد مورفوژن، کوتاهتر از لحظه دوم مربوط به آن است. علاوه بر این، نویز در تعداد مورفوژن تقریبا توسط فاصله از موقعیت سلولی تا منبع مورفوژن تأثیری ندارد. علاوه بر این، ما به بررسی برخی از مقادیر (به عنوان مثال انرژی بالقوه و نیروی انتشار) از نظر مکانیزم های فیزیکی-شیمیایی، و کشف می کنیم که نیروی انتشار یک عامل کلیدی برای تشکیل گرادیان مورفوژن است. نتایج ما بینش مربوط به انتشار مورفوژن را ارائه می دهد.
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه فیزیک و نجوم فیزیک اتمی و مولکولی و اپتیک
چکیده انگلیسی
Morphogen, a class of signaling molecules to direct and control pattern formation of cell and tissue, is first synthesized in a local region and then conveyed to other regions or degraded. In the previous studies, this transport process was modeled by deterministic models of ordinary differential equations. In microcosmic environments, however, the process is often affected by stochastic fluctuations (or the noise). It remains unclear how this noise affects morphogen gradients. Here, we build a spatiotemporal master equation model for the process of morphogen transport in a finite developmental field, from which we derive the first-order moment equations of this master equation. We derive the analytical expression of the local accumulation time that the morphogens reach a steady state, and find that this time is nonlinear with respect to the cell positions. We also derive the approximate expressions of the steady-state variances, the Fano factors and the local accumulation time of the variance. Interestingly, we find that the local accumulation time for the variance of the morphogen number is shorter than that of its corresponding second-order moment. Moreover, the noise in the morphogen number is almost not affected by the distance from the cellular position to morphogen source. In addition, we further study some quantities (e.g., potential energy and diffusion force) from the view of physical-chemical mechanisms, and uncover that the diffusion force is a key factor for the formation of the morphogen gradient. Our results provide insights on morphogen diffusion.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Chinese Journal of Physics - Volume 56, Issue 3, June 2018, Pages 922-931
نویسندگان
, ,