کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8644401 | 1569759 | 2018 | 8 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Identification of microRNAs involved in cold adaptation of Litopenaeus vannamei by high-throughput sequencing
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
miRNAsmRNART-qPCRqPCRcDNA - cDNAComplementary DNA - DNA تکمیلیmessenger RNA - RNA messengerNext-generation sequencing - تعیین توالی نسل بعدیKEGG یا Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes - دایرة المعارف ژن ها و ژنوم کیوتو Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes - دایره المعارف ژنتیک ژن ها و ژنوم کیوتوreverse transcription - رونویسی معکوسCold adaptation - سازگاری سردHour - ساعتUntranslated regions - مناطق غیر ترجمهUTR یا untranslated regions - منطقه ترجمه نشدهLitopenaeus vannamei - میگوی سفید غربی، لیتوپنئوس وانامیGene ontology - هستیشناسی ژنیquantitative polymerase chain reaction - واکنش زنجیره ای پلیمراز کمی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Then, five significantly differential expressed miRNAs under cold acclimation including three known miRNAs (mja-miR-6491, mja-miR-6494, and Bta-miR-2478) and two newly-identified miRNAs (novel_68 and novel_5) were selected for validation by RT-qPCR in the hepatopancreas and muscle tissues of cold treated shrimps. The expression trend of most the miRNAs from RT-qPCR were consistent with the next-generation sequencing data. Further, the Gene Ontology (GO) annotation showed that the metabolic process GO term was significantly enriched with target genes of the differentially expressed miRNAs. Additionally, KEGG pathway analysis suggested that the fatty acid degradation and glycerolipid metabolism pathways etc. are significantly enriched with the target genes. These findings may contribute to a better understanding of the molecular mechanisms governing the responses to low temperature in L. vannamei.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 677, 30 November 2018, Pages 24-31
Journal: Gene - Volume 677, 30 November 2018, Pages 24-31
نویسندگان
Pingping He, Pinyuan Wei, Bin Zhang, Yongzhen Zhao, Qiangyong Li, Xiuli Chen, Digang Zeng, Min Peng, Chunling Yang, Jinxia Peng, Xiaohan Chen,