دانلود مقالات ISI درباره RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه + ترجمه فارسی

Structure based inhibitor design targeting glycogen phosphorylase b. Virtual screening, synthesis, biochemical and biological assessment of novel N-acyl-β-d-glucopyranosylamines

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; GP, glycogen phosphorylase; GPb, rabbit muscle glycogen phosphorylase b; GPa, rat hepatocytes glycogen phosphorylase a; PLP, pyridoxal 5′-phosphate; Glc-1-P, α-d-glucose 1-phosphate; rmsd, root-mean-square deviation; DMF, N,N-dimethylformamide; MeOH, meth

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 16 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Bone conduction in Thiel-embalmed cadaver heads

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; AC, air conduction; BC, bone conduction; LDV, laser Doppler vibrometer; RW, round window; STD, standard deviation; TM, tympanic membrane; ST, stapes; CP, cochlear promontory; SK, skull; RMSD, root-mean-square deviation

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

X-ray crystallography and QM/MM investigation on the oligosaccharide synthesis mechanism of rice BGlu1 glycosynthases

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; QM/MM, quantum mechanical/molecular mechanical; α-GlcF, alpha-glucosyl fluoride; pNPC2, pNP-cellobioside; RMSD, root-mean-square deviation; MD, molecular dynamics; HB, hydrogen bond; R, reactant; TS, transition state; P, productOligosaccharide synthesis;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Anisotropic intersubunit and inter-ring interactions revealed in the native bullet-shaped chaperonin complex from Thermus thermophilus

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; FRET, fluorescence resonance energy transfer; HOF, heat of formation; MO, molecular orbital; MOPAC, molecular orbital package; RMSD, root-mean-square deviation; SCF, self-consistent field; SD, standard deviation; TEM, transmission electron microscopy; TLS

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Isoelectric point optimization using peptide descriptors and support vector machines

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; FDR, False Discovery Rate; IPG, Immobilized pH Gradient; RMSD, Root-mean-square deviation; SVM, Support Vector MachineIsoelectric point; Support vector machine; Peptide descriptors

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2012 سفارش ترجمه

Crystal Structure of the Leucine Aminopeptidase from Pseudomonas putida Reveals the Molecular Basis for its Enantioselectivity and Broad Substrate Specificity

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; ppLAP, Pseudomonas putida leucine aminopeptidase; LAP, leucine aminopeptidase; ecLAP, Escherichia coli leucine aminopeptidase, blLAP, bovine lens leucine aminopeptidase; rmsd, root-mean-square deviation; LPA, l-leucinephosphonic acidleucine aminopeptidase

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2010 سفارش ترجمه

X-ray Crystallographic and MD Simulation Studies on the Mechanism of Interfacial Activation of a Family I.3 Lipase with Two Lids

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; PML, Pseudomonas sp. MIS38 lipase; SML, Serratia marcescens lipase; T1SS, type I secretion system; rmsd, root-mean-square deviation; RTX, repeats in toxins; CMC, critical micelle concentration; DENP, diethyl p-nitrophenyl phosphate; DEP, diethylphospho; p

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 14 صفحه سال انتشار : 2010 سفارش ترجمه

Structure, Evolutionary Conservation, and Conformational Dynamics of Homo sapiens Fascin-1, an F-actin Crosslinking Protein

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; F-actin, filamentous actin; NMA, normal mode analysis; RMSD, root-mean-square deviation; PDB, protein data bank; IL-1β, interleukin-1β; H, hisactophilin; FGF, fibroblast growth factor; MARCKS, myristoylated alanine-rich C-kinase substrate; Se-Met, selenom

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 16 صفحه سال انتشار : 2010 سفارش ترجمه

Activation of the Ghrelin Receptor is Described by a Privileged Collective Motion: A Model for Constitutive and Agonist-induced Activation of a Sub-class A G-Protein Coupled Receptor (GPCR)

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; GHS-R1a, growth hormone secretagogue receptor 1a; MDS, molecular dynamics simulation; NMA, normal mode analysis; GPCR, G protein-coupled receptor; 7TM, seven transmembranous; MRMS, mass weighted root mean square; RMSD, root-mean-square deviation; GHR4, pe

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 16 صفحه سال انتشار : 2010 سفارش ترجمه

Two adjacent mutations on the dimer interface of SARS coronavirus 3C-like protease cause different conformational changes in crystal structure

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; SARS-CoV, severe acute respiratory syndrome coronavirus; 3CLpro, 3C-like protease; RMSD, root-mean-square deviation; MES, 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid; PEG, polyethylene glycol; DTT, dithiothreitol; DMSO, dimethyl sulphoxide; EDTA, ethylene diamine

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2009 سفارش ترجمه

Crystal structure and molecular dynamics simulation of ubiquitin-like domain of murine parkin

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; AR-JP, autosomal recessive juvenile Parkinsonism; esd, estimated standard deviation; DLM, dynamic light scattering; MD, molecular dynamics; PD, Parkinson's disease; rmsd, root-mean-square deviation; SAD, single-wavelength anomalous diffusion; Uld, ubiquit

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه

Crystal Structure of a Minimal Nitroreductase, ydjA, from Escherichia coli K12 with and without FMN Cofactor

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; NTR, nitroreductase; Ec_ydjA, ydjA from E. coli; SeMet, seleno-l-methionine; rmsd, root-mean-square deviation; FMN, flavin mononucleotide; NADH, nicotinamide adenine dinucleotide; PDB, Protein Data BankydjA; nitroreductase; FMN; crystal structure

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه

Structural Basis for Natural Lactonase and Promiscuous Phosphotriesterase Activities

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; PEG, polyethylene glycol; PTE, phosphotriesterase; SsoPox, Sulfolobus solfataricus phosphotriesterase; PLL, phosphotriesterase-like-lactonase; Opd, organophosphorus degrading; OP, organophosphates; rmsd, root-mean-square deviation; AHL, N-acyl-homoserine

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه

Substrate recognition by family 7 alginate lyase from Sphingomonas sp. A1

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; rmsd, root-mean-square deviation; G, α-L-guluronate; M, β-D-mannuronate; strain A1, Sphingomonas sp. A1; A1-I, strain A1 alginate lyase I; A1-II, strain A1 alginate lyase II; A1-III, strain A1 alginate lyase III; A1-IV, strain A1 alginate lyase IV; A1-IV′

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه

Crystal Structure and DNA Binding of the Homeodomain of the Stem Cell Transcription Factor Nanog

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; HD, homeodomain; ES, embryonic stem; ND, N-terminal domain; CD, C-terminal domain; WR, tryptophan repeat; mNanHD, murine Nanog homeodomain; TEV, tobacco etch virus; RMSD, root-mean-square deviation; PDB, Protein Data Bank; NCS, noncrystallographic symmetr

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه

Structural Insights into the Design of Inhibitors for the L1 Metallo-β-lactamase from Stenotrophomonas maltophilia

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; MBL, metallo-β-lactamase; PDB, Protein Data Bank; rmsd, root-mean-square deviation; EXAFS, extended X-ray absorption fine structure; D-cap, 1-(2S)-3-mercapto-2-methyl-propionyl-d-proline; MP2, N-[(benzyloxy) carbonyl]-l-cysteinyl glycineLactamase; metallo

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه

The Role of Multiple Hydrogen-Bonding Groups in Specific Alcohol Binding Sites in Proteins: Insights from Structural Studies of LUSH

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; LGIC, ligand-gated ion channel; PKC, protein kinase C; OBP, odorant binding protein; MD, molecular dynamics; PDB, Protein Data Bank; RMSD, root-mean-square deviation; PEG, polyethylene glycol; ANS, 1-anilino-8-naphthalenesulfonic acid; CD, circular dichro

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 17 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه

Molecular modelling studies on the interactions of human DNA topoisomerase IB with pyridoxal-compounds

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; Human DNA topoisomerase IB; Pyridoxal 5′-phosphate; Pyridoxal 5′-diphospho-5′-adenosine; Molecular modellingPLP, pyridoxal 5′-phosphate; PL, pyridoxal; PLP-AMP, pyridoxal 5′-diphospho-5′-adenosine; RMSD, root-mean-square deviation

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه

Direct Observation of Microscopic Reversibility in Single-molecule Protein Folding

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; protein folding/unfolding; microscopic reversibility; nonnative interactions; protein dynamics; protein refoldingCI2, chymotrypsin inhibitor 2; MD, molecular dynamics; TS, transition state; RMSD, root-mean-square deviation; NOE, nuclear Overhauser effect

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه

Differences in the Electrostatic Surfaces of the Type III Secretion Needle Proteins PrgI, BsaL, and MxiH

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; NOE, nuclear Overhauser effect; NOESY, NOE spectroscopy; HSQC, heteronuclear single-quantum coherence; HMQC, heteronuclear multiple-quantum coherence; RMSD, root-mean-square deviation; TTSA, type III secretion apparatus; TTSS, type III secretion systemSal

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه

Crystallographic and in Silico Analysis of the Sialoside-binding Characteristics of the Siglec Sialoadhesin

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; Ig, Immunoglobulin; BIP, Me-α-9-N-(biphenyl-4-carbonyl)-amino-9-deoxy-Neu5Ac; Neu5NAc, N-acyl neuraminic acid; NOL, unliganded SnD1; AC, 2-benzyl-Neu5NAc; PROP, 2-benzyl-Neu5NPro; RMSD, root-mean-square deviation; Siglec, sialic acid-binding immunoglobuli

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه

The Crystal Structure of Mouse Exo70 Reveals Unique Features of the Mammalian Exocyst

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; PM, plasma membrane; rmsd, root-mean-square deviation; MAD, multi-wavelength anomalous diffractioncrystallography; membrane trafficking; exocytosis; exocyst; Exo70

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه

Structure and Mechanism of HpcG, a Hydratase in the Homoprotocatechuate Degradation Pathway of Escherichia coli

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; 4-HPA, 4-Hydroxyphenylacetic acid; rmsd, root-mean-square deviation; FAH, fumarylacetoacetate hydrolase; HHDD, 2-hydroxy-2,4-heptadiene-1,7-dioateenzyme; intermediate; X-ray crystallography; aromatic; bioremediation

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه

Crystal Structure of Medicago truncatula UGT85H2 – Insights into the Structural Basis of a Multifunctional (Iso)flavonoid Glycosyltransferase

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; UGT, uridine diphosphate glycosyltransferase; rmsd, root-mean-square deviation; PSPG, putative secondary plant glycosyltransferase; TCA, trichloroacetic acidglycosylation; uridine diphosphate glycosyltransferase; isoflavonoid; crystal structure; substrate

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه

Stabilizing IκBα by “Consensus” Design

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; protein folding; ankyrin repeat protein; NF-κB; transcription factor; repeat proteinAR, ankyrin repeat; ANS, 1-Anilinonaphthalene-8-sulfonate; HSQC, heteronuclear single quantum coherence; MD, molecular dynamics; RMSD, root-mean-square deviation

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 16 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه

Folding free-energy landscape of a 10-residue mini-protein, chignolin

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; GB, generalized Born; MD, molecular dynamics; NMR, nuclear magnetic resonance; RMSD, root-mean-square deviation; SA, surface areaFolding simulation; Molecular dynamics; Multicanonical; Generalized Born model; Chignolin; β-Hairpin

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 5 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Flexible docking of an amyloid-forming peptide from β2-microglobulin

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; bm2, β2-microglobulin; TFE, 2,2,2-trifluoroethanol; RMSD, root-mean-square deviation; MD, molecular dynamics; NMR, nuclear magnetic resonance; SSNMR, solid state NMRAmyloid; Flexible docking; Symmetric restraints; Restrained molecular dynamics; β2-microgl

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Nucleosome Core Particles Containing a Poly(dA·dT) Sequence Element Exhibit a Locally Distorted DNA Structure

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; MRE, metal response element; FRET, fluorescence resonance energy transfer; rmsd, root-mean-square deviation; A16, 16 bp poly(dA·dT)crystal structure; fluorescence resonance energy transfer; nucleosome; DNA structure

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Structural basis for epitope sharing between group 1 allergens of cedar pollen

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; Cry j 1, group 1 allergen of Japanese cedar (Cryptomeria japonica); Jun a 1, group 1 allergen of mountain cedar (Juniperus ashei); mAb, monoclonal antibody; MW, molecular weight; PDB, protein data bank; PL, pectate lyase; RMSD, root-mean-square deviation;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

The Allosteric Mechanism of Yeast Chorismate Mutase: A Dynamic Analysis

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; yeast chorismate mutase; allosteric mechanism; normal mode analysis; targeted molecular dynamicsYCM, chorismate mutase; TSA, transition state analog; RMSD, root-mean-square deviation; NMA, normal mode analysis; MD, molecular dynamics; TMD, targeted molecu

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Indirect Readout of DNA Sequence at the Primary-kink Site in the CAP–DNA Complex: Recognition of Pyrimidine-Purine and Purine-Purine Steps

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; catabolite activator protein (CAP); cAMP receptor protein (CRP); protein–DNA interaction; protein-induced DNA bending; indirect readoutCAP, catabolite activator protein; CRP, cAMP receptor protein; RMSD, root-mean-square deviation

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Crystal Structures of Yersinia enterocolitica Salicylate Synthase and its Complex with the Reaction Products Salicylate and Pyruvate

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; siderophore; salicylate; chorismate; Yersinia; anthranilate synthaseADC, 4-amino-4-deoxychorismate; rmsd, root-mean-square deviation

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Kinetic Studies of Folding of the B-domain of Staphylococcal Protein A with Molecular Dynamics and a United-residue (UNRES) Model of Polypeptide Chains

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; staphylococcal protein A; protein folding pathways; protein folding kinetics; molecular dynamics; united-residue force fieldMD, molecular dynamics; RMSD, root-mean-square deviation; RMSE, root-mean-square error; PDB, Protein Data Bank; UNRES, united-resid

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Three-dimensional Structure of Iminodisuccinate Epimerase Defines the Fold of the MmgE/PrpD Protein Family

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; IDS, iminodisuccinate; rmsd, root-mean-square deviation; NCS, non-crystallographic symmetrybiodegradation; enzymology; protein crystallography; protein structure; methylcitrate dehydratase

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Efficient Prediction of Nucleic Acid Binding Function from Low-resolution Protein Structures

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; DNA-binding; protein–DNA interactions; function prediction; structural genomics; dipole momentROC, receiver operator characteristic; AUC, area under the ROC curve; RMSD, root-mean-square deviation; PDB, Protein Data Bank

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Structural Basis for Monoubiquitin Recognition by the Ede1 UBA Domain

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; endocytosis; monoubiquitin signaling; solution structure; UBA domain; ubiquitin-binding motifUBA, ubiquitin associated; NOE, nuclear Overhauser effect; NOESY, NOE spectroscopy; RMSD, root-mean-square deviation

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Role of Structural and Dynamical Plasticity in Sin3: The Free PAH2 Domain is a Folded Module in mSin3B

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; protein–protein interactions; PAH domain; transcription; Sin3; NMRCPMG, Carr–Purcell–Meiboom–Gill; HMG, high mobility group; NOE, nuclear Overhauser effect; O-GlcNAc, O-linked N-acetylglucosamine; RMSD, root-mean-square deviation; PDB, Protein Data Bank;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Structural Basis for Metal Binding Specificity: the N-terminal Cadmium Binding Domain of the P1-type ATPase CadA

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; CadA; NMR; P1-type ATPase; cadmium detoxification; XASTCEP, Tris(2-carboxyethyl)phosphine hydrochloride; NOE, nuclear Overhauser effect; HSQC, heteronuclear single quantum correlation; BBO, Broad band observe; RMSD, root-mean-square deviation; BSV, bond-v

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Crystal Structures of SnoaL2 and AclR: Two Putative Hydroxylases in the Biosynthesis of Aromatic Polyketide Antibiotics

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; anthracycline; enzyme mechanism; evolution; protein crystallography; protein structureNAME, nogalonic acid methyl ester; PEG, polyethylene glycol; rmsd, root-mean-square deviation; ORF, open-reading frame; MAD, multiple wavelength anomalous diffraction

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Expect the Unexpected or Caveat for Drug Designers: Multiple Structure Determinations Using Aldose Reductase Crystals Treated under Varying Soaking and Co-crystallisation Conditions

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; ALR1, aldehyde reductase; ALR2, aldose reductase; rmsd, root-mean-square deviation; MD, molecular dynamicsstructure-based drug design; binding mode; aldose reductase; protein flexibility; molecular dynamics

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 14 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

The Structure of the RNA m5C Methyltransferase YebU from Escherichia coli Reveals a C-terminal RNA-recruiting PUA Domain

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; MTase, methyltransferase; SAM, S-adenosyl l-methionine; SAH, S-adenosyl homocysteine; m5C, 5-methylcytidine; m5U, 5-methyl uridine; SAD, single anomalous dispersion; rmsd, root-mean-square deviation; CYT, cytosine; PUA, pseudouridine synthases and archaeo

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 14 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Refinement of Protein Structures by Iterative Comparative Modeling and CryoEM Density Fitting

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; protein structure prediction; comparative modeling; homology modeling; cryo-electron-microscopy; density fittingcryoEM, cryo-electron microscopy; RDV, rice dwarf virus; BDV, bluetongue virus; RMSD, root-mean-square deviation

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 14 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Structural Basis for the Substrate Specificity of a Bacillus 1,3-1,4-β-Glucanase

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; protein structure; oligosaccharide complex; protein–carbohydrate interactions; active-site mutant; 1,3-1,4-β-glucanaseE·I, enzyme–inhibitor; E·S, enzyme–substrate; RMSD, root-mean-square deviation; E·P, enzyme–product; CBH-I, cellobiohydrolase I; LBHBs, l

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 15 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Crystal Structure of a Glycyl Radical Enzyme from Archaeoglobus fulgidus

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; pyruvate formate lyase; glycerol dehydratase; PFL2; glycyl radical; hyperthermophilePFL, pyruvate formate lyase; GD, glycerol dehydratase; SAXS, small-angle X-ray scattering; rmsd, root-mean-square deviation; SROV, square-roots of variance

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 15 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Rigidity and Flexibility of Dipeptidyl Peptidase IV: Crystal Structures of and Docking Experiments with DPIV

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; dipeptidyl peptidase (DPIV); serine proteinase; crystal structure; diabetes mellitus; flexibilityDPIV, dipeptidyl peptidase; POP, prolyl oligopeptidase; GLP, glucagon-like peptide; rmsd, root-mean-square deviation; tBu-GPI, tert-butyl-Gly-l-Pro-l-Ile; bor

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 16 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Identification of a Collapsed Intermediate with Non-native Long-range Interactions on the Folding Pathway of a Pair of Fyn SH3 Domain Mutants by NMR Relaxation Dispersion Spectroscopy

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; CPMG, Carr-Purcell-Meiboom-Gill; HSQC/HMQC, heteronuclear single/multiple quantum coherence; RMSD, root-mean-square deviation; SH3, Src homology 3; TPPI, time-proportional phase incrementation; NOESY, nuclear Overhauser enhancement spectroscopy; TOCSY, to

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 19 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Crystal Structure of 3-Hydroxybenzoate Hydroxylase from Comamonas testosteroni Has a Large Tunnel for Substrate and Oxygen Access to the Active Site

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; MHBH, 3-hydroxybenzoate hydroxylase; PHBH, 4-hydroxybenzoate hydroxylase; PHHY, phenol hydroxylase; GR, glutathione reductase; MIRAS, multiple isomorphous replacement with anomalous scattering; rmsd, root-mean-square deviation; PCMB, 4-chloromercuribenzoa

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 19 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Structural Basis of Carbohydrate Transfer Activity by Human UDP-GalNAc: Polypeptide α-N-Acetylgalactosaminyltransferase (pp-GalNAc-T10)

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; glycosyltransferase; mucin; O-glycan; retaining enzyme; R-type lectinpp-GalNAc-T, UDP-GalNAc: polypeptide α-N-acetylgalactosaminyltransferase; GalNAc, N-acetylgalactosamine; rmsd, root-mean-square deviation; β4GalT1, β1,4galactosyltransferase-1

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 20 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Probing Molecular Docking in a Charged Model Binding Site

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; molecular docking; electrostatic; solvation; cyctochrome c peroxidase; X-ray crystallographyCCP, cyctochrome c peroxidase; rmsd, root-mean-square deviation; MPD, methylpentanediol; CPCM, conductor-like polarizable continuum model

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 22 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Minimalist Representations and the Importance of Nearest Neighbor Effects in Protein Folding Simulations

Keywords: RMSD، انحراف معیار میانگین ریشه; DOPE, discrete optimized protein energy-function; DOPER, DOPE reduced; PDB, Protein Data Bank; SA, simulated annealing; RMSD, root-mean-square deviation; RB, Ramachandran basin; MD, molecular dynamics; LD, Langevin dynamicsRamachandran basin; structure pr

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 23 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه