کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
10223725 1701046 2018 15 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Hybrid models of genetic networks: Mathematical challenges and biological relevance
ترجمه فارسی عنوان
مدل های ترکیبی شبکه های ژنتیکی: چالش های ریاضی و ارتباط بیولوژیکی
کلمات کلیدی
شبکه های ژنتیک، شبکه های منطقی دینامیک غیر خطی، معادلات تاخیر، زیست شناسی مصنوعی، سینتیک بیوشیمیایی،
ترجمه چکیده
ما نتایج مربوط به پویایی در یک کلاس از معادلات دیفرانسیل معمولی هیبریدی را بررسی میکنیم که شامل کنترل منطقی برای تولید معادلات خطی مکعبی است. این معادلات، ویژگی های کیفی ساختار شبکه ها را به ویژگی های کیفی دینامیک مربوط می کند. به دلیل ساختار ساده آنها، آنها با استفاده از تکنیک های ریاضی گسسته و پویای غیرخطی مورد مطالعه قرار گرفته اند. در ابتدا به عنوان یک توصیف کیفی از شبکه های نظارتی ژنی توسعه یافته است، بسیاری از تعاریف رویکرد اساسی توسعه یافته اند. به طور خاص، ما نشان می دهیم که چگونه این روش کیفی ممکن است برای تغییر سیستم های بیوشیمیایی بدون تخریب سازگار باشد، که نشان دهنده یک نمونه از یک اثر است که در آن دو شاخه های مسیر ممکن است متفاوت با زمانی که آستانه ها برای دو مسیر جدا شده اند، متفاوت تنظیم شوند.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
چکیده انگلیسی
We review results concerning dynamics in a class of hybrid ordinary differential equations which incorporates logical control to yield piecewise linear equations. These equations relate qualitative features of the structure of networks to qualitative properties of the dynamics. Because of their simple structure, they have been studied using techniques from discrete mathematics and nonlinear dynamics. Initially developed as a qualitataive description of gene regulatory networks, many generalizations of the basic approach have been developed. In particular, we show how this qualitative approach may be adapted to switching biochemical systems without degradation, illustrated by an example of a motif in which two branches of a pathway may be regulated differently when the thresholds for the two pathways are separated.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Theoretical Biology - Volume 458, 7 December 2018, Pages 111-118
نویسندگان
, ,