کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
10356114 | 867614 | 2011 | 8 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Enabling enrichment analysis with the Human Disease Ontology
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی کامپیوتر
نرم افزارهای علوم کامپیوتر
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Although it is possible to perform enrichment analysis using ontologies other than the GO, a key pre-requisite is the availability of a background set of annotations to enable the enrichment calculation. In the case of the GO, this background set is provided by the Gene Ontology Annotations. In the current work, we describe: (i) a general method that uses hand-curated GO annotations as a starting point for creating background datasets for enrichment analysis using other ontologies; and (ii) a gene-disease background annotation set - that enables disease-based enrichment - to demonstrate feasibility of our method.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Biomedical Informatics - Volume 44, Supplement 1, December 2011, Pages S31-S38
Journal: Journal of Biomedical Informatics - Volume 44, Supplement 1, December 2011, Pages S31-S38
نویسندگان
Paea LePendu, Mark A. Musen, Nigam H. Shah,