The role of loops on the order of eukaryotes and prokaryotes

مطالعه سازمان سه بعدی کروماتین به تازگی تمرکز زیادی در زمینه تکنیک های جدید برای تشخیص مخاطبین گسترده در ژنوم با استفاده از توالی نسل بعدی است. این روش های مبتنی بر جذب کروموزوم کروموزوم، یک بینش توپولوژیکی عمیق را به معماری ژنوم داخل هسته می دهد. در چندین مطالعه اخیر، توزیع مجدد واکنش های کروماتین به حوزه های محدود محدوده مشاهده شده است. این ویژگی ساختاری کروموزوم های بین فاز نه تنها با مطالعات معمول انجام می شود که اطلاعات متقابل میلیون ها سلول را ارزیابی می کنند، بلکه با تجزیه و تحلیل بر روی سطح یک سلول تک. ما ابتدا مدل های مختلفی ارائه می کنیم که به منظور تشریح این دامنه های توپولوژیک در اواکریوت ها ارائه شده است. سپس ما نشان می دهیم که یک مدل که مبتنی بر تشکیل پویایی حلقه ها در حوزه ها است، می تواند برای نقشه های مشاهده شده توسط آزمایش های تجربی مورد استفاده قرار گیرد. جالب توجه است که ساختار دامنه توپولوژیک نه تنها در ژنوم های پستانداران، بلکه در کروموزوم های باکتری نیز یافت می شود.