کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
10869874 1073976 2015 6 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Analysis of amino acid and codon usage in Paramecium bursaria
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک دانش گیاه شناسی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
Analysis of amino acid and codon usage in Paramecium bursaria
چکیده انگلیسی
The ciliate Paramecium bursaria harbors the green-alga Chlorella symbionts. We reassembled the P. bursaria transcriptome to minimize falsely fused transcripts, and investigated amino acid and codon usage using the transcriptome data. Surface proteins preferentially use smaller amino acid residues like cysteine. Unusual synonymous codon and amino acid usage in highly expressed genes can reflect a balance between translational selection and other factors. A correlation of gene expression level with synonymous codon or amino acid usage is emphasized in genes down-regulated in symbiont-bearing cells compared to symbiont-free cells. Our results imply that the selection is associated with P. bursaria-Chlorella symbiosis.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: FEBS Letters - Volume 589, Issue 20, Part B, 7 October 2015, Pages 3113-3118
نویسندگان
, , ,