کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
10914630 1088803 2014 15 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Standardized decision support in next generation sequencing reports of somatic cancer variants
ترجمه فارسی عنوان
پشتیبانی تصمیم گیری استاندارد شده در گزارش های توالی نسل بعدی از انواع سرطان های سوماتیک
ترجمه چکیده
از صدها تا هزاران جهش اجتماعی که در هر ژنوم سرطانی وجود دارد، تعداد زیادی از آنها منحصر به فرد و غیرقابل بازگشت هستند. اولویت بندی انواع ژنتیکی که از طریق تکنولوژی توالی نسل بعدی شناسایی شده است، یک چالش عمده است. بسیاری از این گونه ها در ژن های توموری وجود دارند که دارای اهمیت بیولوژیکی و بالینی هستند و اهداف قابل ملاحظه ای از درمان مولکولی هستند، اما اغلب انواع هنوز مشخص نیست. با مقادیر زیادی از داده های تولید شده به عنوان تست های توالی سنجی توانایی بالا وارد قلمرو بالینی، نیاز به رشد بیشتر در ارتباط با یافته های مربوطه به موقع در حالی که باقی می ماند آگاهی از پیامدهای احتمالی سوء استفاده یا تفسیر اطلاعات ژنتیکی وجود دارد. در اینجا چارچوبی سیستماتیک برای حاشیه نویسی متنوع و اولویت بندی را توصیف می کنیم و ما یک گزارش پاتولوژی مولکولی ساختاری با استفاده از اصطلاحات استاندارد برای ارائه بهترین شیوه های بالینی شناسی را ارائه می دهیم. ما امیدواریم که تجربه ما در ایجاد یک پایگاه اطلاعاتی جامع از نشانگرهای پیش بینی کننده در حال ظهور که به درمان های هدفمند کمک می کند، به سایر موسسات برنامه های مشابهی را کمک می کند.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی تحقیقات سرطان
چکیده انگلیسی
Of hundreds to thousands of somatic mutations that exist in each cancer genome, a large number are unique and non-recurrent variants. Prioritizing genetic variants identified via next generation sequencing technologies remains a major challenge. Many such variants occur in tumor genes that have well-established biological and clinical relevance and are putative targets of molecular therapy, however, most variants are still of unknown significance. With large amounts of data being generated as high throughput sequencing assays enter the clinical realm, there is a growing need to better communicate relevant findings in a timely manner while remaining cognizant of the potential consequences of misuse or overinterpretation of genomic information. Herein we describe a systematic framework for variant annotation and prioritization, and we propose a structured molecular pathology report using standardized terminology in order to best inform oncology clinical practice. We hope that our experience developing a comprehensive knowledge database of emerging predictive markers matched to targeted therapies will help other institutions implement similar programs.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Molecular Oncology - Volume 8, Issue 5, July 2014, Pages 859-873
نویسندگان
, , , , , , ,