کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
11017733 1721165 2018 24 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
The genetic code is not an optimal code in a model taking into account both the biosynthetic relationships between amino acids and their physicochemical properties
ترجمه فارسی عنوان
کد ژنتیکی یک مدل مطلوب در یک مدل نیست و با توجه به روابط بیوسنتز بین اسیدهای آمینه و خواص فیزیکی و شیمیایی آنها
کلمات کلیدی
بهینه سازی کد ژنتیکی، کد ژنتیکی مطلوب، مبادله اسید آمینه، نظریه هماهنگی کد ژنتیک،
ترجمه چکیده
نتایج این فرضیه را حفظ می کند که سازماندهی کد ژنتیکی حتی در این زیرمجموعه ها دارای تعداد محدودی از عناصر مطلوب نیست. به عبارت دیگر، کد ژنتیکی حداقل محلی یا مطلق نیست. به عنوان مثال، تنها چند مبادله اسید آمینه ممکن است کد ژنتیکی را بهینه سازی کرده و یا حتی آن را تبدیل به یک کد به طور کامل بهینه سازی شده است. این بدان معنی است که تکامل کد ژنتیکی، بدون در نظر گرفتن این امکانات، از طریق مسیرهای مختلف از آن که به یک بهینه سازی بالا هدایت شده است، تکامل یافته است. علاوه بر این، ترکیبی از قطب و حجم مولکولی اسید آمینه نتایج مهمتری نسبت به زمانی که تنها قطبیت در نظر گرفته شده است، در تهویه تکامل کد ژنتیک بر خلاف آنچه در ادبیات گزارش شده است. با این حال، این به این معنا نیست که سازمان کد کد ژنتیکی بهینه سازی شده در صورتی که به این دو ویژگی اشاره شود، نیست. با این وجود، این دو خصوصیت در تعیین ساختار پروتئین ها بسیار مهم هستند، آنها می توانند منشأ کد ژنتیکی را با استفاده از فشار انتخابی جهت بهبود کاتالیزوری آنزیمی اجدادی، تحت تاثیر قرار دهند. به طور کلی این مشاهدات با پیش بینی های نظریه های فیزیکوشیمیایی مبدأ کد ژنتیک مخالف است؛ زیرا عدم بهینه سازی سازمان کد ژنتیک - حتی در زیر مجموعه های کد با تعداد بسیار کم عنصر - اهمیت مطلق فیزیکی و شیمیایی خواص اسیدهای آمینه در ساختار آن، که، برعکس، از این نظریه ها انتظار می رود. برعکس، این مشاهدات مشابه در نظریه هماهنگی منشاء کد ژنتیکی هماهنگی کاملی دارند، زیرا آنها هر دو نقش اساسی خواص فیزیکی و شیمیایی را در سازماندهی کد ژنتیکی و اهمیت این خواص در تکامل کدگذاری کاتالیزوری - به عبارت دیگر، از کد ژنتیکی - هر دو پیش بینی شده توسط این نظریه آخر.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
پیش نمایش مقاله
کد ژنتیکی یک مدل مطلوب در یک مدل نیست و با توجه به روابط بیوسنتز بین اسیدهای آمینه و خواص فیزیکی و شیمیایی آنها
چکیده انگلیسی
The results maintain the hypothesis that the genetic code organization is not optimal even in these subsets containing a very limited number of elements. That is to say, the genetic code is not a local or absolute minimum. For instance, only a few amino acid exchanges would have rendered the genetic code more optimized or even they would have transformed it into a completely optimized code. This would imply that the evolution of the genetic code, not considering these possibilities, has evolved through different pathways from the one that was oriented to a high optimization. Moreover, the combination of polarity and the molecular volume of amino acids results to have been more significant than when the only polarity is considered, in conditioning the evolution of the genetic code contrary to that reported in the literature. However, this is not such to produce an organization of the genetic code optimized if referred to these two properties. Nevertheless, these two properties being crucial in defining the structure of proteins, they would have affected the origin of the genetic code by means of the selective pressure directed to improve the ancestral enzymatic catalysis. As a whole these observations contradict the predictions of the physicochemical theories of the origin of the genetic code because the non-optimization of the genetic code organization - even in subsets of codes with a very low element number - would deny the absolute importance of the physicochemical properties of amino acids in its structuration, which, on the contrary, is expected from these theories. Conversely, these same observations would be in perfect agreement with the coevolution theory of the origin of the genetic code because they would explain both the not fundamental role of the physicochemical properties in organizing the genetic code and the importance of these properties in the evolution of coded catalysis - that is to say, of the genetic code - both predicted by this last theory.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Theoretical Biology - Volume 459, 14 December 2018, Pages 45-51
نویسندگان
, ,