کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
1145524 1489669 2014 20 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Posterior analysis of rare variants in Gibbs-type species sampling models
ترجمه فارسی عنوان
تجزیه و تحلیل جایگزین انواع نادر در مدل نمونه گیبس نوع گونه
ترجمه چکیده
مشکلات نمونه برداری از گونه ها تاریخچه طولانی در مطالعات زیست محیطی و بیولوژیکی دارد و تعدادی از مسائل آماری، از جمله ارزیابی غنای گونه، هنوز مورد توجه قرار گرفته است. در این مقاله، با استناد به استنتاج غیر پارامتری بیزی برای مشکلات نمونه برداری گونه، ما مسئله عملا مهم و فنی را به چالش کشیدن از توسعه یک تجزیه و تحلیل جامع خلفی از به اصطلاح انواع نادر، یعنی کسانی که با فرکانس کمتر یا برابر با فراوانی داده شده آستانه. به طور خاص، با اتخاذ یک نوع پیش گیبس، ما یک بیان صریح برای توزیع مشترک خلفی تعداد فرکانس از انواع نادر را ارائه می دهیم، و برخی از خواص آماری آن را بررسی می کنیم. نتایج پیشنهادی با استفاده از دو برنامه ریشه در یک مجموعه داده ژنومی معیار نشان داده شده است.
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه ریاضیات آنالیز عددی
چکیده انگلیسی
Species sampling problems have a long history in ecological and biological studies and a number of statistical issues, including the evaluation of species richness, are still to be addressed. In this paper, motivated by Bayesian nonparametric inference for species sampling problems, we consider the practically important and technically challenging issue of developing a comprehensive posterior analysis of the so-called rare variants, namely those species with frequency less than or equal to a given abundance threshold. In particular, by adopting a Gibbs-type prior, we provide an explicit expression for the posterior joint distribution of the frequency counts of the rare variants, and we investigate some of its statistical properties. The proposed results are illustrated by means of two novel applications to a benchmark genomic dataset.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Multivariate Analysis - Volume 131, October 2014, Pages 79-98
نویسندگان
, , ,