کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
1899993 | 1045212 | 2006 | 15 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Ergodic pumping: A mechanism to drive biomolecular conformation changes
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
ریاضیات
ریاضیات کاربردی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
We propose that a significant contribution to the power stroke of myosin and similar conformation changes in other biomolecules is the pressure of a single molecule (e.g. a phosphate ion) expanding a trap, a mechanism we call “ergodic pumping”. We demonstrate the principle with a toy computer model and discuss the mathematics governing the evolution of slow degrees of freedom in large Hamiltonian systems. We indicate in detail how the mechanism could fit with known features of the myosin cycle. Many other biomolecular conformation changes could be driven in part by ergodic pumping. We suggest the use of ergodic pumping as a design principle in nanobiotechnology.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Physica D: Nonlinear Phenomena - Volume 216, Issue 1, 1 April 2006, Pages 220–234
Journal: Physica D: Nonlinear Phenomena - Volume 216, Issue 1, 1 April 2006, Pages 220–234
نویسندگان
R.S. MacKay, D.J.C. MacKay,