کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
2048874 | 1074104 | 2010 | 5 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Prediction of pathogenicity islands in Enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7 using genomic barcodes
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم کشاورزی و بیولوژیک
دانش گیاه شناسی
پیش نمایش صفحه اول مقاله

چکیده انگلیسی
The genome of lethal animal pathogenic bacterium Enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) O157:H7 is characterized by the presence of multiple pathogenicity islands (PAIs). Computational methods have been developed to identify PAIs based on the distinguishing G + C levels in some PAI versus non-PAI regions. We observed that PAIs can have a very similar G + C level to that of the host chromosome, which may have led to false negative predictions using these methods. We have applied a novel method of genomic barcodes to identify PAIs. Using this technique, we have successfully identified both known and novel PAIs in the genomes of three strains of EHEC O157:H7.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: FEBS Letters - Volume 584, Issue 1, 4 January 2010, Pages 194–198
Journal: FEBS Letters - Volume 584, Issue 1, 4 January 2010, Pages 194–198
نویسندگان
Guoqing Wang, Fengfeng Zhou, Victor Olman, Fan Li, Ying Xu,