کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
2051809 | 1074210 | 2005 | 6 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
A problem in multivariate analysis of codon usage data and a possible solution
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم کشاورزی و بیولوژیک
دانش گیاه شناسی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Multivariate analyses are often used to identify major trends of variation in synonymous codon usage among genes. These analyses need to be performed on properly normalized codon usage data to avoid biases masking this synonymous variation, i.e., gene length, amino acid usage, and codon degeneracy; however, previous studies have failed to do so. In this paper, we demonstrate that the use of alternative normalized data (called ‘relative adaptiveness’ in the literature) can avoid all these biases and furthermore, can identify more trends of variation among genes, including GC-ending codon usage, GT-ending codon usage, and gene expression level.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: FEBS Letters - Volume 579, Issue 28, 21 November 2005, Pages 6499–6504
Journal: FEBS Letters - Volume 579, Issue 28, 21 November 2005, Pages 6499–6504
نویسندگان
Haruo Suzuki, Rintaro Saito, Masaru Tomita,