کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
2186352 | 1096051 | 2009 | 10 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Refinement of Protein Structures into Low-Resolution Density Maps Using Rosetta
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
بیولوژی سلول
پیش نمایش صفحه اول مقاله
![عکس صفحه اول مقاله: Refinement of Protein Structures into Low-Resolution Density Maps Using Rosetta Refinement of Protein Structures into Low-Resolution Density Maps Using Rosetta](/preview/png/2186352.png)
چکیده انگلیسی
We describe a method based on Rosetta structure refinement for generating high-resolution, all-atom protein models from electron cryomicroscopy density maps. A local measure of the fit of a model to the density is used to directly guide structure refinement and to identify regions incompatible with the density that are then targeted for extensive rebuilding. Over a range of test cases using both simulated and experimentally generated data, the method consistently increases the accuracy of starting models generated either by comparative modeling or by hand-tracing the density. The method can achieve near-atomic resolution starting from density maps at 4–6 Å resolution.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Molecular Biology - Volume 392, Issue 1, 11 September 2009, Pages 181–190
Journal: Journal of Molecular Biology - Volume 392, Issue 1, 11 September 2009, Pages 181–190
نویسندگان
Frank DiMaio, Michael D. Tyka, Matthew L. Baker, Wah Chiu, David Baker,