Analysis of molecular genetic diversity of cardoon (Cynara cardunculus L.) in Tunisia

The objective of this study is to investigate the genetic diversity, the relationships among six Tunisian wild cardoon populations (Cynara cardunculus var. sylvestris) and a Tunisian's population of cultivated cardoon (Cynara cardunculus var. altilis DC) in seven different geographical locations (Tiurif, Bahra, Zriba, Bouficha, Enfidha, Beja and Wad mliz) from semi-arid and wet regions of Tunisia. Twenty-three selected microsatellite markers are used for a sample of 98 cardoon genotypes. The total of 243 alleles is detected in the studied populations and the number of alleles per locus ranged from six to 23. The dendrogram based on Nei's (1972) UPGMA method divides the seven studied populations to five clusters. These preliminary results show that microsatellites are effective tools for plant species characterization and the analysed populations have a high genetic variability and will be suitable as genetic stocks for conservation and sustainable utilization programs of Cynara cardunculus L. in Tunisia.

RésuméCette étude s’est intéressée à l’investigation de l’analyse de la diversité moléculaire et des relations phylogéniques entre six populations du cardon sauvage (Cynara cardunculus var. sylvestris) et une du cardon cultivé (Cynara cardunculus var. altilis DC) dans six régions semi-arides et une humide de la Tunisie : Tiurif, Bahra, Zriba, Bouficha, Enfidha, Béja et Wad mliz. Vingt-trois marqueurs microsatellites ont été utilisés pour génotyper 98 individus. Au total 243 allèles ont été détectés pour les sept populations, le nombre d’allèles par locus varie de six à 23. Le dendrogramme basé sur la méthode d’UPGMA de Nei's (1972) a permis de diviser les sept populations étudiées en cinq groupes distincts, ces résultats préliminaires montrent que les microsatellites sont un outil prometteur pour caractériser les espèces végétales et indiquent que les sept populations étudiées ont une diversité génétique satisfaisante qui peut être utilisée comme base pour aménager des programmes de conservation et de développement durable de Cynara cardunculus L. en Tunisie.