کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
2821977 1570117 2016 3 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Microarray analyses for identifying genes conferring resistance to pepper leaf curl virus in chilli pepper (Capsicum spp.)
ترجمه فارسی عنوان
تجزیه و تحلیل ریزآرایه ها برای شناسایی ژن هایی که باعث مقاومت در برابر ویروس پیچ‌خوردگی برگ فلفل در فلفل قرمز (گونه کپسیکوم) می شوند
کلمات کلیدی
Begomovirus؛ مکانیسم مولکولی؛ هیبریداسیون گونه های متقاطع؛ Agilent
فهرست مطالب مقاله
چکیده

کلمات کلیدی

1. لینک مستقیم داده های ذخیره شده

2.مقدمه

3. مواد و روش ها

1.3. مواد گیاهی و تلقیح ویروسی

2.3. جداسازی RNA و سنتز cRNA

3.3. دورگ‌گیری ریزآرایه ها، اسکن و تجزیه و تحلیل داده ها

4.3. تجزیه و تحلیل MapMan ژن های واکنش‌پذیر  ویروسی

5.3. تجزیه و تحلیل کمی RT-PCR

4. نتیجه گیری

شکل 1. طرح و نمودار ویسکر  نسبت log توزیع داده های ریزآرایه پس از طبیعی سازی
ترجمه چکیده
ویروس پیچ‌خوردگی برگ فلفل (PepLCV) یک تهدید جدی برای تولید فلفل (گونه کپسیکوم ) در سراسر جهان است. واکنش های مولکولی پاسخ گیاهان فلفل به عفونت PepLCV کلید توسعه رقم های مقاوم در برابر PepLCV می باشد. در این مطالعه، ما پروفیل های ترنسکریپتومی ژنوتیپ مقاوم PepLCV (BS-35) و ژنوتیپ حساس (IVPBC-535) پس از تلقیح ویروس مصنوعی با استفاده از فناوری ریزآرایه تولید کردیم و جزئیات روش های تجربی و تجزیه و تحلیل ها شرح داده شده است. در مجموع 319 ژن با بیان متفاوت در بین ژنوتیپ های مقاوم و حساس شناسایی شده اند. مشخص شده است که از این تعداد، 234 ژن منحصر به فرد در دودمانه مقاوم BS-35 در مقایسه با دودمانه حساس IVPBC-535، بیش از 2 برابر تنظیم افزایشی شده است. مجموعه داده ای که ما تولید کردیم برای شناسایی ژن هایی مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفته است که در تنظیم مقاومت در برابر PepLCV دخیل هستند. داده های خام دورگ‌گیری متقابل گونه ها در پایگاه داده بیان ژن اومنیبوس (GEO) تحت شماره GSE41131 ثبت شده است.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی ژنتیک
پیش نمایش مقاله
تجزیه و تحلیل ریزآرایه ها برای شناسایی ژن هایی که باعث مقاومت در برابر ویروس پیچ‌خوردگی برگ فلفل در فلفل قرمز (گونه کپسیکوم) می شوند
چکیده انگلیسی

Pepper leaf curl virus (PepLCV) is a serious threat to pepper (Capsicum spp.) production worldwide. Molecular mechanism underlying pepper plants response to PepLCV infection is key to develop PepLCV resistant varieties. In this study, we generated transcriptome profiles of PepLCV resistant genotype (BS-35) and susceptible genotype (IVPBC-535) after artificial viral inoculation using microarray technology and detail experimental procedures and analyses are described. A total of 319 genes differentially expressed between resistant and susceptible genotypes were identified, out of that 234 unique genes were found to be up-regulated > 2-fold in resistant line BS-35 when compared to susceptible, IVPBC-535. The data set we generated has been analyzed to identify genes that are involved in the regulation of resistance against PepLCV. The raw data have been deposited in the Gene Expression Omnibus (GEO) database under accession number GSE41131.

ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Genomics Data - Volume 9, September 2016, Pages 140–142
نویسندگان
, , , , , , ,