کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
418758 | 681715 | 2009 | 14 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
A mathematical program to refine gene regulatory networks
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی کامپیوتر
نظریه محاسباتی و ریاضیات
پیش نمایش صفحه اول مقاله
![عکس صفحه اول مقاله: A mathematical program to refine gene regulatory networks A mathematical program to refine gene regulatory networks](/preview/png/418758.png)
چکیده انگلیسی
In this paper, we propose a methodology for making sense of large, multiple time-series data sets arising in expression analysis. Specifically, we present a mathematical model to release a reduced and coherent regulatory system given a putative regulatory network. We give two equivalent formulations of the problem and prove that the problem is NP-complete. For solving large scale instances we implemented an Ant Colony Optimization procedure. A computational analysis on randomly generated test instances validates the proposed algorithm and the computations on real data concerning Saccharomyces cerevisiae show the practicability of the proposed methodology.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Discrete Applied Mathematics - Volume 157, Issue 10, 28 May 2009, Pages 2469–2482
Journal: Discrete Applied Mathematics - Volume 157, Issue 10, 28 May 2009, Pages 2469–2482
نویسندگان
Guglielmo Lulli, Martin Romauch,