کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
436156 689974 2015 17 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Parameterized and approximation algorithms for maximum agreement forest in multifurcating trees
ترجمه فارسی عنوان
الگوریتم های پارامتریک و تقریبی برای حداکثر جنگل توافق درختان چند منظوره
کلمات کلیدی
الگوریتم تقریبی، ردیابی پارامتر پارامتر درخت فیلوژنتیک، حداکثر جنگل توافقنامه
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه مهندسی کامپیوتر نظریه محاسباتی و ریاضیات
چکیده انگلیسی

We study parameterized algorithms and approximation algorithms for the maximum agreement forest problem, which, for two given leaf-labeled trees, is to find a maximum forest that is a subgraph of both trees. The problem was motivated by research in phylogenetics. For parameterized algorithms, while the problem is known to be fixed-parameter tractable for binary trees, it was an open problem whether the problem is still fixed-parameter tractable for general trees. We resolve this open problem by developing an O(3kn)O(3kn)-time parameterized algorithm for general trees. Our techniques on tree structures also lead to a polynomial-time approximation algorithm of ratio 3 for the problem, giving the first constant-ratio approximation algorithm for general trees.

ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Theoretical Computer Science - Volume 562, 11 January 2015, Pages 496–512
نویسندگان
, , ,