کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
4495833 | 1623815 | 2016 | 8 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
An estimator for local analysis of genome based on the minimal absent word
ترجمه فارسی عنوان
برآوردگر تجزیه و تحلیل محلی ژنوم بر اساس حداقل کلمه خالی است
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
مقایسه بصری، بدون تراز ویژگی نسبی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم کشاورزی و بیولوژیک
علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
چکیده انگلیسی
• A comparison model is proposed based on the minimal absent word.
• Smooth-local-analysis-curve and similarity-distribution are constructed.
• A distance measure is deduced based on probability model.
• The method has potential advantages over the local alignment method.
This study presents an alternative alignment-free relative feature analysis method based on the minimal absent word, which has potential advantages over the local alignment method in local analysis. Smooth-local-analysis-curve and similarity-distribution are constructed for a fast, efficient, and visual comparison. Moreover, when the multi-sequence-comparison is needed, the local-analysis-curves can illustrate some interesting zones.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Theoretical Biology - Volume 395, 21 April 2016, Pages 23–30
Journal: Journal of Theoretical Biology - Volume 395, 21 April 2016, Pages 23–30
نویسندگان
Lianping Yang, Xiangde Zhang, Haoyue Fu, Chenhui Yang,