کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
4497581 | 1318942 | 2010 | 10 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
New method for global alignment of 2 DNA sequences by the tree data structure
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم کشاورزی و بیولوژیک
علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
We introduce a new approach to investigate problem of DNA sequence alignment. The method consists of three parts: (i) simple alignment algorithm, (ii) extension algorithm for largest common substring, (iii) graphical simple alignment tree (GSA tree). The approach firstly obtains a graphical representation of scores of DNA sequences by the scoring equation R0*RâS0*SâT0*(a+bk). Then a GSA tree is constructed to facilitate solving the problem for global alignment of 2 DNA sequences. Finally we give several practical examples to illustrate the utility and practicality of the approach.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Theoretical Biology - Volume 263, Issue 2, 21 March 2010, Pages 227-236
Journal: Journal of Theoretical Biology - Volume 263, Issue 2, 21 March 2010, Pages 227-236
نویسندگان
Zhao-Hui Qi, Xiao-Qin Qi, Chen-Chen Liu,