کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
4498106 | 1318965 | 2009 | 11 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Models of transcription factor binding: Sensitivity of activation functions to model assumptions
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم کشاورزی و بیولوژیک
علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
We present three models of how transcription factors (TFs) bind to their specific binding sites on the DNA: a model based on statistical physics, a Markov-chain model and a computational simulation. Comparison of these models suggests that the effect of non-specific binding can be significant. We also investigate possible mechanisms for cooperativity. The simulation model suggests that direct interactions between TFs are unlikely to be the main source of cooperativity between specific binding sites, because such interactions tend to lead to the formation of clusters on the DNA with undesirable side-effects.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Theoretical Biology - Volume 257, Issue 3, 7 April 2009, Pages 419–429
Journal: Journal of Theoretical Biology - Volume 257, Issue 3, 7 April 2009, Pages 419–429
نویسندگان
Dominique Chu, Nicolae Radu Zabet, Boris Mitavskiy,