کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
4765086 1423854 2017 4 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Shotgun metagenomic data on the human stool samples to characterize shifts of the gut microbial profile after the Helicobacter pylori eradication therapy
ترجمه فارسی عنوان
داده های مگنتومیک تفنگ ساچمهای بر روی نمونه های مدفوع انسانی برای مشخص کردن تغییرات مشخصات میکروبی روده پس از درمان ریشه کنی هلیکوباکتر پیلوری
کلمات کلیدی
میکروب بیوتین روده انسانی، هلیکوباکتر پیلوری، قلع و قمع، آنتی بیوتیک ها،
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه مهندسی شیمی مهندسی شیمی (عمومی)
چکیده انگلیسی

The shotgun sequencing data presented in this report are related to the research article named “Gut microbiome shotgun sequencing in assessment of microbial community changes associated with H. pylori eradication therapy” (Khusnutdinova et al., 2016) [1]. Typically, the H. pylori eradication protocol includes a prolonged two-week use of the broad-spectrum antibiotics. The presented data on the whole-genome sequencing of the total DNA from stool samples of patients before the start of the eradication, immediately after eradication and several weeks after the end of treatment could help to profile the gut microbiota both taxonomically and functionally. The presented data together with those described in Glushchenko et al. (2017) [2] allow researchers to characterize the metagenomic profiles in which the use of antibiotics could result in dramatic changes in the intestinal microbiota composition. We perform 15 gut metagenomes from 5 patients with H. pylori infection, obtained through the shotgun sequencing on the SOLiD 5500 W platform. Raw reads are deposited in the ENA under project ID PRJEB21338.

ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Data in Brief - Volume 14, October 2017, Pages 458-461
نویسندگان
, , , , , , , , ,