کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
497050 | 862875 | 2011 | 8 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Metaheuristics based de novo protein sequencing: A new approach
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی کامپیوتر
نرم افزارهای علوم کامپیوتر
پیش نمایش صفحه اول مقاله

چکیده انگلیسی
In this article, a new approach is proposed for the de novo protein sequencing problem. The aim is to find the sequence of an experimental protein from only experimental data, i.e. without databases. To do so, a three-step model called SSO for Shape, Sequence and Order has been designed. No prior knowledge in genomics nor protein databases are used. Here we modelized de novo protein sequencing as a combinatorial optimisation problem and propose cooperative metaheuristics to solve it. Results are assessed on experimental proteins and proved the feasibility of this approach.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Applied Soft Computing - Volume 11, Issue 2, March 2011, Pages 2271-2278
Journal: Applied Soft Computing - Volume 11, Issue 2, March 2011, Pages 2271-2278
نویسندگان
Jean-Charles Boisson, Laetitia Jourdan, El-Ghazali Talbi,