کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
524237 | 868576 | 2007 | 8 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Scalable parallel suffix array construction
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی کامپیوتر
نرم افزارهای علوم کامپیوتر
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Suffix arrays are a simple and powerful data structure for text processing that can be used for full text indexes, data compression, and many other applications in particular in bioinformatics. We describe the first implementation and experimental evaluation of a scalable parallel algorithm for suffix array construction. The implementation works on distributed memory computers using MPI, Experiments with up to 512 processors show good constant factors and make it look likely that the algorithm could also be adapted to even larger systems. This makes it possible to build suffix arrays for huge inputs very quickly. Our algorithm is a parallelization of the linear time DC3 algorithm.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Parallel Computing - Volume 33, Issue 9, September 2007, Pages 605–612
Journal: Parallel Computing - Volume 33, Issue 9, September 2007, Pages 605–612
نویسندگان
Fabian Kulla, Peter Sanders,