Epsilonproteobacteria dominate bacterial diversity at a natural tar seep

Nous avons caractérisé la diversité bactérienne au niveau d'une source naturelle de bitume altéré par séquençage d'une librairie de gènes ribosomiques 16S clonés. Nous avons observé que la diversité bactérienne est largement dominée par des Epsilonprotéobactéries dans le bitume et dans l'eau souterraine. Ces Epsilonprotéobactéries représentent 75 % de la diversité bactérienne totale. Cette diversité est dominée avant tout par les OTU de Sulfurimonas, que complètent des OTU de Sulfurovum et Arcobacter. Les Epsilonprotéobactéries sont des bactéries chimiolithotrophes, oxydant les sulfures et réduisant les nitrates, incapables d'assimiler les molécules organiques, mais capables de fixer le carbone des carbonates dissouts. Ainsi, les composés soufrés, et non la matière organique complexe du bitume, seraient dégradés par les communautés bactériennes du Puy-de-la-Poix. La présence massive d'Epsilonprotéobactéries indique que l'interface eau hydrothermale/bitume offre une niche écologique favorable à ces microorganismes.