Archaeobotanical reconstructions of vegetation and report of mummified apple seeds found in the cellar of a first-century Roman villa on Elba Island

Durant l'époque romaine républicaine tardive (du IIe au Ier siècle avant J.-C.), dans une région historiquement dédiée à l'extraction de minerai de fer, une villa rustica a été installée à San Giovanni, sur l'île d'Elbe, par Marco Valerio Messala, un magistrat « suprême » romain. Les fouilles du site archéologique ont permis de mettre en évidence les fondations du bâtiment. Des études stratigraphiques et paléobotaniques ont été effectuées. Plus précisément, l'observation de couches palynologiques a montré la présence de différents palynomorphes, dont de nombreux restes non polliniques. De plus, une étude anthracologique a confirmé l'hypothèse de l'incendie de la villa au Ier siècle après J.-C., qui a détruit l'édifice et a conduit à la création d'une épaisse et compacte croûte de cendres sous laquelle ont été retrouvées quatre amphores romaines partiellement cassées, mais contenant environ cinq cents pépins de pommes momifiés. La comparaison entre ces pépins archéologiques et des pépins actuels issus de collections de référence a montré une forte différence morphologique, sauf pour un unique groupe d'échantillons fossiles. L'ADN des groupes de pépins de chaque amphore a été isolé à l'aide des spécimens les mieux conservés présentant un embryon toujours intact. Le produit d'extraction de l'ADN archéologiques et de grains actuels de pommes sauvages (Malus sylvestris) ou cultivées (M. domestica) a ensuite été amplifié par PCR. Une analyse des différents génomes a enfin été effectuée à l'aide de marqueurs moléculaires de type SSR.