کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5589395 | 1569799 | 2017 | 8 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Comprehensive evaluation of candidate reference genes for gene expression studies in Lysiphlebia japonica (Hymenoptera: Aphidiidae) using RT-qPCR
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
RPL18RPL27β-tubulinRT-qPCRRibosomal protein L27qRT-PCROBPSEF1aORFsTBPRNA polymerase II - آرانای پلیمراز II 18S ribosomal RNA - RNA ریبوزوم 18Sβ-actin - β-اکتینArginine kinase - آرژنین کینازstandard deviation - انحراف معیارelongation factor 1 alpha - ضریب اصطکاک 1 آلفاActb - عملOpen reading frames - فریم های خواندن را باز کنیدNormalization - نرمالیزاسیون یا عادی سازیtub - وانQuantitative reverse transcriptase-polymerase chain reaction - واکنش زنجیره ای ترانس کریتاز - پلیمریزا معکوسTATA binding protein - پروتئین متصل به TATAodorant-binding proteins - پروتئین های متصل کننده شکنندهReference gene - ژن مرجعolfactory receptor - گیرنده بویایی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
پیش نمایش صفحه اول مقاله
![عکس صفحه اول مقاله: Comprehensive evaluation of candidate reference genes for gene expression studies in Lysiphlebia japonica (Hymenoptera: Aphidiidae) using RT-qPCR Comprehensive evaluation of candidate reference genes for gene expression studies in Lysiphlebia japonica (Hymenoptera: Aphidiidae) using RT-qPCR](/preview/png/5589395.png)
چکیده انگلیسی
Lysiphlebia japonica (Ashmead) is a predominant parasitoid of cotton-melon aphids in the fields of northern China with a proven ability to effectively control cotton aphid populations in early summer. For accurate normalization of gene expression in L. japonica using quantitative reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-qPCR), reference genes with stable gene expression patterns are essential. However, no appropriate reference genes is L. japonica have been investigated to date. In the present study, 12 selected housekeeping genes from L. japonica were cloned. We evaluated the stability of these genes under various experimental treatments by RT-qPCR using four independent (geNorm, NormFinder, BestKeeper and Delta Ct) and one comparative (RefFinder) algorithm. We identified genes showing the most stable levels of expression: DIMT, 18S rRNA, and RPL13 during different stages; AK, RPL13, and TBP among sexes; EF1A, PPI, and RPL27 in different tissues, and EF1A, RPL13, and PPI in adults fed on different diets. Moreover, the expression profile of a target gene (odorant receptor 1, OR1) studied during the developmental stages confirms the reliability of the chosen selected reference genes. This study provides for the first time a comprehensive list of suitable reference genes for gene expression studies in L. japonica and will benefit subsequent genomics and functional genomics research on this natural enemy.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 637, 30 December 2017, Pages 211-218
Journal: Gene - Volume 637, 30 December 2017, Pages 211-218
نویسندگان
Xue-Ke Gao, Shuai Zhang, Jun-Yu Luo, Chun-Yi Wang, Li-Min Lü, Li-Juan Zhang, Xiang-Zhen Zhu, Li Wang, Hui Lu, Jin-Jie Cui,