کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
5760220 1623796 2017 22 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Limited by sensing - A minimal stochastic model of the lag-phase during diauxic growth
ترجمه فارسی عنوان
محدود با حساسیت - حداقل مدل تصادفی از فاز تاخیر در طول رشد نیتروژن
کلمات کلیدی
رشد نیتروژن کامپیوترهای برونیا، سیستم های تصادفی سنسورهای زیستی،
ترجمه چکیده
بسیاری از میکروبها وقتی که در مخلوطی از دو منبع کربنی رشد می کنند، ابتدا و به طور انحصاری شکر ترجیح داده می شوند، قبل از اینکه به منبع کربن کمتر توجه کنند. این نتیجه در دو مرحله رشد مجزا متقارن، که اغلب توسط فاز انقباضی رشد کاهش یافته نامیده می شود، فاز انقباض را متوقف می کند. در حالی که فاز عقب به نظر می رسد یک ویژگی تکامل یافته است، روشن نیست که چه چیزی تکامل خود را در بر می گیرد، چرا که با افزایش قابل توجهی از مجازات تناسب اندام جلو می رود. در این مقاله، یک مدل ریاضی حداقل بر اساس رویکرد معادلات استاد ارائه شده است. این مدل می تواند بسیاری از پدیده های تجربی را مشاهده کند. این نشان می دهد که فاز انقباض می تواند به عنوان یک تظاهرات تجاری بین سرعت سوئیچینگ و راندمان سوئیچ شناخته شده درک شود. علاوه بر این، مدل پیش بینی ناهمگونی جمعیت در طول فاز عقب است. در نهایت نشان داده شده است که سوئیچ از یک منبع کربن به یکی دیگر، یک مشکل حسابی است و فاز عقب مانع محدودیت شناختی شناخته شده سنسورهای بیولوژیکی می شود.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
چکیده انگلیسی
Many microbes when grown on a mixture of two carbon sources utilise first and exclusively the preferred sugar, before switching to the less preferred carbon source. This results in two distinct exponential growth phases, often interrupted by a lag-phase of reduced growth termed the lag-phase. While the lag-phase appears to be an evolved feature, it is not clear what drives its evolution, as it comes with a substantial up-front fitness penalty due to lost growth. In this article a minimal mathematical model based on a master-equation approach is proposed. This model can explain many empirically observed phenomena. It suggests that the lag-phase can be understood as a manifestation of the trade-off between switching speed and switching efficiency. Moreover, the model predicts heterogeneity of the population during the lag-phase. Finally, it is shown that the switch from one carbon source to another one is a sensing problem and the lag-phase is a manifestation of known fundamental limitations of biological sensors.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Theoretical Biology - Volume 414, 7 February 2017, Pages 137-146
نویسندگان
,