کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
5760319 1623780 2017 50 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Exact results for the probability and stochastic dynamics of fixation in the Wright-Fisher model
ترجمه فارسی عنوان
نتایج دقیق برای احتمال و دینامیک تصادفی ثابت در مدل رایت فیشر
کلمات کلیدی
رانش ژنتیکی تصادفی مسیرهای فرکانس، روند تصادفی، انتخاب وابسته به فرکانس، انتخاب قوی،
ترجمه چکیده
در این کار ما ثابت کردن یک آلل در جمعیت است. رفع اشکال کلیدی است که درک راه تغییرات تکاملی درازمدت در سطوح ژنی و مولکولی رخ می دهد. دو جنبه اساسی تثبیت عبارتند از: (1) احتمال آن رخ می دهد و (2) نحوه فرکانس ژن به تثبیت. ما نتایج دقیق برای هر دو جنبه ثابت برای مدل رایت فیشر ارائه می کنیم. ما احتمال احتمالی ثابت برای برخی از طرح های مختلف از انتخاب وابسته به فرکانس ارائه می دهیم. ما همچنین معادله دیفرانسیل اختلاف دقیق مربوطه را به وجود می آوریم که مسیرهای فرکانس را که در نهایت حل می شود، تولید می کند. دقیق بودن نتایج بدین معنی است که انتخاب نباید ضعیف باشد. برنامه های کاربردی این کار برای تجزیه و تحلیل داده ها، مدل سازی و آزمایش تقریبی ها وجود دارد. روش شناخته شده نشان داده است که آگاهی از احتمالات ثابت برای همه فرکانس های اولیه، به طور کامل مشخصه پویایی مدل رایت فیشر است. معادلات تصادفی برای تثبیت خطوط مسیریابی، امکان بینش را به نحوی که ثابت می شود، نشان می دهد. آنها یک تصویر جایگزین را فراهم می کنند که ثابت بودن تزریق یک حامل آلل ثابت را به جمعیت هر نسل هدایت می کند. معادلات احتمالی اجازه می دهد محاسبه صریح برخی از خواص مسیرهای ثابت و شبیه سازی کارآمد آنها. نتایج با شبیه سازی نشان داده شده و آزمایش می شوند.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
چکیده انگلیسی
In this work we consider fixation of an allele in a population. Fixation is key to understanding the way long-term evolutionary change occurs at the gene and molecular levels. Two basic aspects of fixation are: (i) the chance it occurs and (ii) the way the gene frequency progresses to fixation. We present exact results for both aspects of fixation for the Wright-Fisher model. We give the exact fixation probability for some different schemes of frequency-dependent selection. We also give the corresponding exact stochastic difference equation that generates frequency trajectories which ultimately fix. Exactness of the results means selection need not be weak. There are possible applications of this work to data analysis, modelling, and tests of approximations. The methodology employed illustrates that knowledge of the fixation probability, for all initial frequencies, fully characterises the dynamics of the Wright-Fisher model. The stochastic equations for fixing trajectories allow insight into the way fixation occurs. They provide the alternative picture that fixation is driven by the injection of one carrier of the fixing allele into the population each generation. The stochastic equations allow explicit calculation of some properties of fixing trajectories and their efficient simulation. The results are illustrated and tested with simulations.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Theoretical Biology - Volume 430, 7 October 2017, Pages 64-77
نویسندگان
, ,