کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5913724 | 1162699 | 2016 | 7 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Scipion: A software framework toward integration, reproducibility and validation in 3D electron microscopy
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شناسی مولکولی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
In the past few years, 3D electron microscopy (3DEM) has undergone a revolution in instrumentation and methodology. One of the central players in this wide-reaching change is the continuous development of image processing software. Here we present Scipion, a software framework for integrating several 3DEM software packages through a workflow-based approach. Scipion allows the execution of reusable, standardized, traceable and reproducible image-processing protocols. These protocols incorporate tools from different programs while providing full interoperability among them. Scipion is an open-source project that can be downloaded from http://scipion.cnb.csic.es.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Structural Biology - Volume 195, Issue 1, July 2016, Pages 93-99
Journal: Journal of Structural Biology - Volume 195, Issue 1, July 2016, Pages 93-99
نویسندگان
J.M. de la Rosa-TrevÃn, A. Quintana, L. del Cano, A. ZaldÃvar, I. Foche, J. Gutiérrez, J. Gómez-Blanco, J. Burguet-Castell, J. Cuenca-Alba, V. Abrishami, J. Vargas, J. Otón, G. Sharov, J.L. Vilas, J. Navas, P. Conesa, M. Kazemi, R. Marabini,