کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
5913935 1162711 2015 11 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Seeing tobacco mosaic virus through direct electron detectors
ترجمه فارسی عنوان
مشاهده ویروس موزاییک دخانیات از طریق آشکارسازهای الکترون مستقیم
کلمات کلیدی
ویروس موزاییک توتون، آشکارسازهای الکترون مستقیم کریو میکروسکوپ الکترونی با وضوح بالا، بازسازی کویل تک ذره، آسیب تابشی،
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی زیست شناسی مولکولی
چکیده انگلیسی
With the introduction of direct electron detectors (DED) to the field of electron cryo-microscopy, a wave of atomic-resolution structures has become available. As the new detectors still require comparative characterization, we have used tobacco mosaic virus (TMV) as a test specimen to study the quality of 3D image reconstructions from data recorded on the two direct electron detector cameras, K2 Summit and Falcon II. Using DED movie frames, we explored related image-processing aspects and compared the performance of micrograph-based and segment-based motion correction approaches. In addition, we investigated the effect of dose deposition on the atomic-resolution structure of TMV and show that radiation damage affects negative carboxyl chains first in a side-chain specific manner. Finally, using 450,000 asymmetric units and limiting the effects of radiation damage, we determined a high-resolution cryo-EM map at 3.35 Å resolution. Here, we provide a comparative case study of highly ordered TMV recorded on different direct electron detectors to establish recording and processing conditions that enable structure determination up to 3.2 Å in resolution using cryo-EM.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Structural Biology - Volume 189, Issue 2, February 2015, Pages 87-97
نویسندگان
, , , , ,