کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
5913983 1162714 2015 14 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Alignment of direct detection device micrographs using a robust Optical Flow approach
ترجمه فارسی عنوان
تطبیق میکروسکوپ های دستگاه تشخیص مستقیم با استفاده از یک جریان نوری قوی
کلمات کلیدی
دستگاه های تشخیص مستقیم پرتو حرکت القا شده، تجزیه و تحلیل ذرات تک میکروسکوپ الکترونی،
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی زیست شناسی مولکولی
چکیده انگلیسی

The introduction of direct detection devices in cryo-EM has shown that specimens present beam-induced motion (BIM). Consequently, in this work, we develop a BIM correction method at the image level, resulting in an integrated image in which the in-plane BIM blurring is compensated prior to particle picking. The methodology is based on a robust Optical Flow (OF) approach that can efficiently correct for local movements in a rapid manner. The OF works particularly well if the BIM pattern presents a substantial degree of local movements, which occurs in our data sets for Falcon II data. However, for those cases in which the BIM pattern corresponds to global movements, we have found it advantageous to first run a global motion correction approach and to subsequently apply OF. Additionally, spatial analysis of the Optical Flow allows for quantitative analysis of the BIM pattern. The software that incorporates the new approach is available in XMIPP (http://xmipp.cnb.csic.es).

ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Structural Biology - Volume 189, Issue 3, March 2015, Pages 163-176
نویسندگان
, , , , , , ,