کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5920045 | 1164278 | 2013 | 6 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Next-generation phylogenomics using a Target Restricted Assembly Method
ترجمه فارسی عنوان
نسل بعدی فیلوژنومیک با استفاده از روش جمعآوری هدف محدود
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم کشاورزی و بیولوژیک
بوم شناسی، تکامل، رفتار و سامانه شناسی
چکیده انگلیسی
⺠We develop a Target Restricted Assembly Method for obtaining phylogenomic data from next-generation sequencing reads. ⺠This method uses BLAST searches of reads from a single Illumina lane to identify matching reads for target genes. ⺠Matching reads are assembled locally to produce complete single copy nuclear protein coding sequences. ⺠In an example with 20 species of lice (Psocodea) we recover sequences for 10 genes and perform a phylogenetic analysis.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Molecular Phylogenetics and Evolution - Volume 66, Issue 1, January 2013, Pages 417-422
Journal: Molecular Phylogenetics and Evolution - Volume 66, Issue 1, January 2013, Pages 417-422
نویسندگان
Kevin P. Johnson, Kimberly K.O. Walden, Hugh M. Robertson,