کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
6368830 1623798 2017 6 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Protein-protein interactions can be predicted using coiled coil co-evolution patterns
ترجمه فارسی عنوان
تعاملات پروتئین-پروتئین را می توان با استفاده از الگوهای هماهنگ تکامل کویل مورد بررسی قرار داد
ترجمه چکیده
متابولیسم پروتئین-پروتئین، گاهی اوقات با ساختار کویل کوپلینگ متصل می شود. حفاظت تکاملی ارتوخلاقات تعامل در گونه های مختلف، همراه با وجود یا عدم وجود کویل های کویل در آنها، ممکن است در پیش بینی جفت های تعامل کمک کند. در اینجا ما نشان می دهیم که چگونه حضور کویل های کویل شده در یک پروتئین را می توان به عنوان یک نشانگر بالقوه برای تعامل با پروتئین دیگر با کویل های کوپلینگ مورد بهره برداری قرار داد. قابلیت پیش بینی استراتژی ما هنگامی که مجموعه داده های ما را محدود به ارتباطات پروتئین و پروتئین بسیار قابل اعتماد و شناخته شده بهبود می بخشد. مطالعه ما در مورد همکاری تکامل کویل های کویل نشان می دهد که جفت های پروتئین های تعامل می تواند از طریق جفت های در تعامل با اطلاعات ساختاری آنها متفاوت باشد. این اشاره به پتانسیل استراتژی ما برای پیش بینی تعاملات پروتئین و پروتئین جدید است.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
چکیده انگلیسی
Protein-protein interactions are sometimes mediated by coiled coil structures. The evolutionary conservation of interacting orthologs in different species, along with the presence or absence of coiled coils in them, may help in the prediction of interacting pairs. Here, we illustrate how the presence of coiled coils in a protein can be exploited as a potential indicator for its interaction with another protein with coiled coils. The prediction capability of our strategy improves when restricting our dataset to highly reliable, known protein-protein interactions. Our study of the co-evolution of coiled coils demonstrates that pairs of interacting proteins can be distinguished from not interacting pairs by means of their structural information. This hints at the potential of our strategy to predict new protein-protein interactions.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Theoretical Biology - Volume 412, 7 January 2017, Pages 198-203
نویسندگان
, , ,