کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
6369089 | 1623804 | 2016 | 23 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Protein sequence analysis by incorporating modified chaos game and physicochemical properties into Chou's general pseudo amino acid composition
ترجمه فارسی عنوان
تجزیه و تحلیل توالی پروتئین با استفاده از بازی هرج و مرج اصلاح شده و خواص فیزیکوشیمیایی به ترکیب شبه آمینواسید کلی
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
تجزیه و تحلیل دنباله، کادون، نقطه ایزوالکتریک، شاخص هیدروپاتی، پروتئین بردار،
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم کشاورزی و بیولوژیک
علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
چکیده انگلیسی
In this contribution we introduced a novel graphical method to compare protein sequences. By mapping a protein sequence into 3D space based on codons and physicochemical properties of 20 amino acids, we are able to get a unique P-vector from the 3D curve. This approach is consistent with wobble theory of amino acids. We compute the distance between sequences by their P-vectors to measure similarities/dissimilarities among protein sequences. Finally, we use our method to analyze four datasets and get better results compared with previous approaches.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Theoretical Biology - Volume 406, 7 October 2016, Pages 105-115
Journal: Journal of Theoretical Biology - Volume 406, 7 October 2016, Pages 105-115
نویسندگان
Chunrui Xu, Dandan Sun, Shenghui Liu, Yusen Zhang,