Unravelling the relationship between protein sequence and low-complexity regions entropies: Interactome implications

مناطق کم پیچیدگی پس از توالی ترکیب ترکیبی در دنباله پروتئین هستند. تأثیر این مناطق بر تکامل پروتئین، توابع خاص و ظرفیت بسیار تعاملی شناخته شده است. اگر چه آنتروپی توالی پروتئین تا حد زیادی مورد مطالعه قرار گرفته است، ارتباط آن با مناطق کم پیچیدگی و اثرات بعدی آن بر عملکرد پروتئین هنوز معلوم نشده است. در این کار ما یک مدل نظری و تجربی را با هم تلفیق آنتروپی توالی با پارامترهای پیچیدگی محلی پیشنهاد می کنیم. نتایج ما نشان می دهد که آنتروپی توالی پروتئین با طول پروتئین، آنتروپی در داخل و خارج از مناطق کم پیچیدگی و همچنین تعداد و اندازه آنها مرتبط است. ما یک افزایش کوچک اما قابل توجهی در انتروپی توالی پروتئین های هاب پیدا کردیم. با توجه به مدل نظری ما، این افزایش به شدت وابسته به تعادل بین افزایش طول پروتئین و اندازه متوسط ​​مناطق کم پیچیدگی است. در نهایت، مدل های ما و تجزیه و تحلیل پروتئین شواهدی وجود دارد که نشان می دهد که تغییرات در اندازه های متوسط ​​در پروتئین های توپی بیشتر از تغییرات در تعدادی از مناطق کم کم پیچیده است.