کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
6370719 1623875 2013 4 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
The standard lateral gene transfer model is statistically consistent for pectinate four-taxon trees
ترجمه فارسی عنوان
مدل انتقال ژن جانبی از لحاظ آماری برای درختان پکتینات چهار تاکسون است
کلمات کلیدی
ترجمه چکیده
حوادث تکاملی مانند مرتب سازی نامتقارن نسبی و انتقال ژن های جانبی باعث مشکلات زیادی برای کشف درخت های درخت از درخت های ژنی می شود، زیرا گاهی اوقات می تواند به درخت های ژنی منجر شود که با درخت گونه های درهم شکسته می شود. یکی از روش های بسیار ساده و کارآمد برای ارزیابی درخت های گونه ای از درختان ژنی در چنین شرایطی، تجزیه و تحلیل سه تاکسون برای چندین ژن با استفاده از روش رای اکثریت است. برای مرتب سازی نسل ناقص این روش شناخته شده است که از لحاظ آماری سازگار است؛ با این حال، برای انتقال ژن جانبی، اخیرا نشان داده شده است که یک ناحیه تناقض برای یک توپولوژی درخت چهار طبقه خاص وجود دارد و این مسئله به عنوان یک پرسش باز است که آیا ممکن است تناقضاتی برای توپولوژی های چهار تاخت درخت وجود داشته باشد؟ در این نامه، تمام توپولوژی های چهارگانه باقی مانده را تجزیه و تحلیل می کنیم و نشان می دهیم که هیچ تناقض دیگری وجود ندارد.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
چکیده انگلیسی
Evolutionary events such as incomplete lineage sorting and lateral gene transfers constitute major problems for inferring species trees from gene trees, as they can sometimes lead to gene trees which conflict with the underlying species tree. One particularly simple and efficient way to infer species trees from gene trees under such conditions is to combine three-taxon analyses for several genes using a majority vote approach. For incomplete lineage sorting this method is known to be statistically consistent; however, for lateral gene transfers it was recently shown that a zone of inconsistency exists for a specific four-taxon tree topology, and it was posed as an open question whether inconsistencies could exist for other four-taxon tree topologies? In this letter we analyze all remaining four-taxon topologies and show that no other inconsistencies exist.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Theoretical Biology - Volume 335, 21 October 2013, Pages 295-298
نویسندگان
, , ,