کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
6874170 1441026 2018 6 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Geometric medians in reconciliation spaces of phylogenetic trees
ترجمه فارسی عنوان
میانه های هندسی در فضاهای مصالح درختان فیلوژنتیکی
کلمات کلیدی
مشکلات ترکیبی هندسی هندسی، فضای تطبیق ویرایش فاصله، مصالحه اجماع،
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه مهندسی کامپیوتر نظریه محاسباتی و ریاضیات
چکیده انگلیسی
In this paper, we study the following question: How do we compute a geometric median for a given subset Ψ of R(P,H,ϕ) relative to d, i.e. an element ψmed∈R(P,H,ϕ) such that∑ψ′∈Ψd(ψmed,ψ′)≤∑ψ′∈Ψd(ψ,ψ′) holds for all ψ∈R(P,H,ϕ)? For a model where so-called host-switches or transfers are not allowed, and for a commonly used metric d called the edit-distance, we show that it is possible to compute a geometric median for a set Ψ in R(P,H,ϕ) in polynomial time. We expect that this result could open up new directions for computing a consensus for a set of reconciliations.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Information Processing Letters - Volume 136, August 2018, Pages 96-101
نویسندگان
, , , ,