کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
6877740 | 692958 | 2014 | 7 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
MDWiZ: A platform for the automated translation of molecular dynamics simulations
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
شیمی
شیمی تئوریک و عملی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
- The MDWiZ platform for the one-click, automated translation of molecular dynamics simulation is presented.
- MDWiZ version 1.0 allows conversions from GROMACS to LAMMPS independently of the force field used and simulation set up with a 10â9Â kJÂ molâ1 internal numerical accuracy for energies.
- A rigorous validation on a set of molecular systems with complementary chemical topologies is presented.
- MDWiZ version 1.0 is freely accessible as a web portal.
- The MDWiZ platform is being extended to other software engines and force fields to automate format conversion and aid the accurate comparison of alternative simulation protocols.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Molecular Graphics and Modelling - Volume 48, March 2014, Pages 80-86
Journal: Journal of Molecular Graphics and Modelling - Volume 48, March 2014, Pages 80-86
نویسندگان
Victor H. Rusu, Vitor A.C. Horta, Bruno A.C. Horta, Roberto D. Lins, Riccardo Baron,