Apport de la CGH-array au diagnostic prénatal d’anomalies génomiques chez des fœtus présentant des signes malformatifs, avec un caryotype apparemment équilibré

RésuméObjectifCertains fœtus présentent des signes évocateurs d’anomalie chromosomique (polymalformations, retard de croissance, hyper clarté nucale…), avec un caryotype apparemment équilibré. L’étude des chromosomes selon les techniques de cytogénétique classique ne permet pas la mise en évidence de remaniements déséquilibrés du génome dont la taille est inférieure à 5 mégabases (Mb), telles que les microdélétions des régions télomériques ou interstitielles. La comparative genomic hybridization array (CGH-array) permet la mise en évidence de remaniements génomiques de petite taille, en analysant un grand nombre de fragments d’ADN du génome. Nous proposons d’utiliser cette méthode, pour établir une corrélation phénotype–génotype de plusieurs fœtus présentant un syndrome malformatif sans anomalie cytogénétique.MéthodeLe principe de la technique est comparable à la CGH classique. Le remplacement des chromosomes par une série de clones d’ADN spécifiques de ces chromosomes offre un avantage significatif concernant la résolution qui est à la hauteur du nombre de clones utilisés. La technique de CGH-array est réalisée sur puces ADN, (BAC), Genosystem®, selon leurs instructions. Les résultats anormaux ont été vérifiés par Fish.RésultatsTrois déséquilibres chromosomiques ont été identifiés et caractérisés précisément (une tétrasomie 12p, une délétion du bras long d’un chromosome 7 dans la région Sonic Hedgehog et une délétion terminale d’un chromosome 7, par cytogénétique moléculaire.Discussion et conclusionLe but de cette étude est d’étendre cette méthodologie, chez tous les fœtus ayant des signes d’appel échographiques très évocateurs d’anomalie chromosomique et dont le caryotype conventionnel est normal ou apparemment équilibré.

ObjectiveIn prenatal diagnosis, some polymalformed foetuses with suspicion of chromosomal abnormalities have normal standard karyotype. Routine chromosome analysis identifies structural rearrangements greater than 5 Mb but cannot identify abnormalities of the telomeric regions or microdeletions reliably. Molecular cytogenetic techniques were developed to overcome these limitations. BAC-based array comparative genomic hybridization array (CGH-array) were developed to increase the resolution of chromosomal studies and to provide a comprehensive assay by using large-insert clones as the target for analysis. We propose to use this technology to better understand the pathology in few foetuses with polymalformation syndrome and apparently balanced karyotype.Materials and methodsComparative genomic hybridization has been used extensively to document gains and losses of genomic DNA in diseases such as cancer and mental retardation the development of CGH using arrays has improved the resolution of these analyses, allowing better detection. We used DNA microarrays (Genosystem®) according to their instruction. Abnormalities have been confirmed by Fish.ResultsIn three cases, this technology allowed us to correlate the abnormal phenotype with an imbalance chromosomal abnormality, (a tetrasomy 12p corresponding to a Pallister-Killian syndrome, a deletion of 7qter on derivative 10 of an inherited maternal reciprocal translocation t(7;10). In the third case, the prenatal caryotype of a foetus with holoprosencephaly showed a de novo apparently balanced reciprocal translocation t(7;8). By Fish, we identified an additional deletion in the region of the Sonic Hedgehog gene.Discussion and conclusionWe show the feasibility and the usefulness of CGH-array in constitutional cytogenetics.