The phylogeny of squamate reptiles (lizards, snakes, and amphisbaenians) inferred from nine nuclear protein-coding genes

Les squamates comprennent environ 8000 espèces actuelles et forment une composante majeure de la faune de vertébrés terrestres. Les relations phylogénétiques entre les familles actuelles de squamates sont inférées par analyses de séquences de neuf gènes nucléaires codant pour des protéines (C-mos, RAG1, RAG2, R35, HOXA13, JUN, α-énolase, amélogénine, MAFB). Notre jeu de données comprend 6192 paires de bases pour 19 taxons représentant toutes les lignées majeures de squamates, et permet d'obtenir une phylogénie largement résolue nécessitant une nouvelle classification. Les Dibamidae sont la lignée la plus basale de squamates. Parmi toutes les autres lignées de squamates (Bifurcata), ce sont les Gekkonidae qui sont en position basale. Les Unidentata comprennent les squamates qui ne sont ni des Dibamidae, ni des Gekkonidae, et sont divisés en deux grands groupes : les Scinciformata (Xantusiidae, Cordylidae, et Scincidae) et les Episquamata. Les Episquamata comprennent les Laterata (Teiformata, Lacertiformata, et Amphisbaenia, ces deux dernières lignées formant un clade nommé Lacertibaenia) et les Toxicofera (Iguania, Anguimorpha, et Serpentes). Les plus proches parents des serpents ne sont ni les varans, ni des lignées fouisseuses telles que les Amphisbaenia ou les Dibamidae, mais sont les Anguimorpha et/ou les Iguania. Notre étude rejette la monophylie des Scleroglossa et des Autarchoglossa, les Iguania occupant une position très dérivée au sein des squamates. Ainsi les Iguania ne représentent pas un stade primitif de l'évolution des squamates, mais constituent au contraire une lignée spécialisée riche en espèces (environ 1440 sp.) utilisant un mode de chasse à l'affût, une détection des proies à l'aide de la vue, et une technique de préhension à l'aide de la langue, et se nourrissant principalement de proies évitées par les autres squamates. Nos estimations des temps de divergence montrent que le Triassique et le Jurassique (il y a entre 250 et 150 millions d'années) ont été des périodes importantes dans l'évolution et la diversification des squamates. Pour citer cet article : N. Vidal, S.B. Hedges, C. R. Biologies 328 (2005).