دانلود مقالات ISI درباره مدل سازی همگرا + ترجمه فارسی

Strategies for developing protein tyrosine phosphatase inhibitors

Keywords: مدل سازی همگرا; Protein tyrosine phosphatases; PTPs; Small molecule PTP inhibitors; Inhibitor development; HTS; Virtual screening; Docking; Homology modeling; SAR; Lead optimization

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه

Hybrid homology modeling and mutational analysis of cytochrome P450C24A1 (CYP24A1) of the Vitamin D pathway: Insights into substrate specificity and membrane bound structure–function

Keywords: مدل سازی همگرا; Vitamin D; Calcitriol; 25-hydroxyvitamin D3 24R-hydroxylase; 1,25-dihydroxyvitamin D3; Vitamin D inactivation; Cytochrome P450; CYPs; P450C24A1; CYP24A1; Site-directed mutagenesis; Homology modeling; Affinity labeling; Monotopic membrane protein

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه

A pathway for protons in nitric oxide reductase from Paracoccus denitrificans

Keywords: مدل سازی همگرا; NOR; bacterial nitric oxide reductase; HCuO; heme-copper oxidase; CcO; cytochrome c oxidase; DDM; β-d-dodecyl maltoside; HEPES; 4-(2-Hydroxyethyl)-piperazine-1-ethanesulfonic acid; BTP; Bis-Tris Propane; HARC; hexa-amineruthenium(II)-chloride; v-NOR; NOR

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه

Membrane protein prediction methods

Keywords: مدل سازی همگرا; Membrane proteins; Protein structure prediction; Protein function prediction; Alignments; Transmembrane segment prediction; Homology modeling; ab initio modeling

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 15 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه

Computer aided comparative analysis of the binding modes of the adenosine receptor agonists for all known subtypes of adenosine receptors

Keywords: مدل سازی همگرا; Adenosine receptor; Agonist; Binding mode; Homology modeling; Docking

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 15 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه

Distinct Acidic Clusters and Hydrophobic Residues in the Alternative Splice Domains X1 and X2 of α7 Integrins Define Specificity for Laminin Isoforms

Keywords: مدل سازی همگرا; wt, wild-type; FACS, fluorescence-activated cell sorting; RU, resonance unitAlpha7 integrin; X1,X2 splice variants; laminin isoforms; homology modeling; molecular dynamics simulation

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 16 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه

A homology model of SERT based on the LeuTAa template

Keywords: مدل سازی همگرا; The serotonin transporter (SERT); Homology modeling; Template

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Towards structural biology in the genus Mytilus: On-line homology modeling with Geno3D

Keywords: مدل سازی همگرا; Biomarker; Mytilus; Homology modeling; Stress-response; Protein; Structure;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Structural model of the OPA1 GTPase domain may explain the molecular consequences of a novel mutation in a family with autosomal dominant optic atrophy

Keywords: مدل سازی همگرا; optic atrophy; OPA1; homology modeling; dynamin A

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 5 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Comparative protein modeling and surface analysis of Leishmania sirtuin: A potential target for antileishmanial drug discovery

Keywords: مدل سازی همگرا; NAM, nicotinamide; NAC, nicotinic acid; SIR2, silent information regulator2; MOE, molecular operating environmentLeishmania; Sir2 NAD; Homology modeling; MOE; MEPS

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Homology modeling of milk enzymes using on-line resources: Insights to structure-function and evolutionary relationships

Keywords: مدل سازی همگرا; Milk enzymes; Plasmin; Homology modeling; Geno3D

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Comparative study on the structure and cytopathogenic activity of HIV Vpr/Vpx proteins

Keywords: مدل سازی همگرا; HIV-1; HIV-2; Vpr; Vpx; Homology modeling; Cytopathogenic activity

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Catalytic specificity of pea O-methyltransferases suggests gene duplication for (+)-pisatin biosynthesis

Keywords: مدل سازی همگرا; D7OMT; daidzein 7-O-methyltransferase; HI4′OMT; 2,7,4′-trihydroxyisoflavanone 4′-O-methyltransferase; HMM; (+)-6a-hydroxymaackiain 3-O-methyltransferase; SAM; S-adenosyl-l-methionine; Glycyrrhiza echinata; Pisum sativum; Leguminosae; Homology modeli

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Why WrbA is weaker than flavodoxin in binding FMN. A molecular modeling study

Keywords: مدل سازی همگرا; Homology modeling; Docking calculations; Protein evolution; Hydrogen bonds; Hydrophobic interactions;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Structural identification of a novel thioredoxin SoxS: Prediction of the function in the process of transport of reductants during sulfur oxidation by the novel global sulfur oxidation reaction cycle

Keywords: مدل سازی همگرا; Sulfur oxidation; Homology modeling; Molecular dynamics; Protein-protein interaction;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Structural study of two proteins SigE and ORF1 to predict their roles in the biochemical oxidation of sulfur anions via the global sulfur oxidation operon (sox)

Keywords: مدل سازی همگرا; Sulfur oxidation; Homology modeling; Transcription factor; DNA–protein interaction; Protein–protein interaction

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Role of each residue in catalysis in the active site of pyrimidine nucleoside phosphorylase from Bacillus subtilis: A hybrid QM/MM study

Keywords: مدل سازی همگرا; Homology modeling; Dock; Molecular dynamics; QM/MM; Polarization; Glycosidic bond; Docking; Electrostatic interactions; Polarization effects; Quantum mechanics; Quantum-mechanical/molecular-mechanical

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Role of metal ions in ligand–receptor interaction: Insights from structural studies

Keywords: مدل سازی همگرا; Signal transduction; G protein-coupled receptors; Peptide hormones; Mu-opioid receptor; Homology modeling; Receptor-metal ion-ligand ternary complex

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

The A-loop, a novel conserved aromatic acid subdomain upstream of the Walker A motif in ABC transporters, is critical for ATP binding

Keywords: مدل سازی همگرا; ABC, ATP-binding cassette; CFTR, cystic fibrosis transmembrane regulator; NBD, nucleotide-binding domain; Pgp, P-glycoprotein; TM, Transmembrane domainABC transporter; ATP hydrolysis; Nucleotide-binding domain; Homology modeling; Multidrug resistance; Seq

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Structural insight into the interactions of SoxV, SoxW and SoxS in the process of transport of reductants during sulfur oxidation by the novel global sulfur oxidation reaction cycle

Keywords: مدل سازی همگرا; Sulfur oxidation; Homology modeling; Molecular dynamics; Protein-protein interaction;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Homology modeling of membrane proteins: A critical assessment

Keywords: مدل سازی همگرا; Membrane proteins; 3-Dimensional structure; Homology modeling; Low sequence identity; Stereochemical quality; Structural similarity; Fold

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Structure of C-terminal fragment of merozoite surface protein-1 from Plasmodium vivax determined by homology modeling and molecular dynamics refinement

Keywords: مدل سازی همگرا; Homology modeling; Molecular dynamics; Malaria; P. vivax; MSP-119

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Construction of an additional metal-binding site in human metallothionein-2

Keywords: مدل سازی همگرا; metallothionein; metal-thiolate; homology modeling; molecular orbital calculation; site-directed mutagenesisAAS, atomic absorption spectrometry; Apo-MT, metal-free form of MT; CD, circular dichroism; Cd5Zn2-MT, cadmium, zinc-metallothionein; hMT-2, human

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Computational study of human phosphomannose isomerase: Insights from homology modeling and molecular dynamics simulation of enzyme bound substrate

Keywords: مدل سازی همگرا; Mannose-6-phosphate (M6P); Phosphomannose isomerase (PMI); Homology modeling; Molecular dynamics simulation

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Homology modeling of the DNA-binding domain of human Smad5: A molecular model for inhibitor design

Keywords: مدل سازی همگرا; Homology modeling; Smads; Transforming growth factor-beta; Phylogenetic analysis; Inhibitor design

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Human cytidine deaminase: A three-dimensional homology model of a tetrameric metallo-enzyme inferred from the crystal structure of a distantly related dimeric homologue

Keywords: مدل سازی همگرا; Cytidine deaminase; Homology modeling; Sequence alignment; Phylogenetic analysis; Evolution

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Oxidatively stable maltopentaose-producing α-amylase from a deep-sea Bacillus isolate, and mechanism of its oxidative stability validated by site-directed mutagenesis

Keywords: مدل سازی همگرا; BLA, α-amylase from B. licheniformis; G1, glucose; G2, maltose; G3, maltotriose; G4, maltotetraose; G5, maltopentaose; MES, 2-morpholinoethanesulphonic acidα-Amylase; Bacillus; Deep-sea; Homology modeling; Maltopentaose; Oxidative stability; Site-directed

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Characterization of the farnesyl pyrophosphate synthase of Trypanosoma cruzi by homology modeling and molecular dynamics

Keywords: مدل سازی همگرا; Chagas’ disease; Homology modeling; Molecular dynamics; Bisphosphonates; Farnesyl pyrophosphate synthase

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Homology modeling and molecular dynamics study of chorismate synthase from Shigella flexneri

Keywords: مدل سازی همگرا; Shigella flexneri; Chorismate synthase; Homology modeling; Molecular dynamics simulation; Protein–ligand interaction

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Extensive analysis of different allelelic structures of the chicken BF2 and β2m proteins

Keywords: مدل سازی همگرا; Chicken; BF2; β2-Microglobulin; Secondary structure; Circular dichroism spectrum; Homology modeling

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Cloning, expression, partial characterization and structural modeling of a novel esterase from Pyrococcus furiosus

Keywords: مدل سازی همگرا; Esterases; Lipases; Proteases; Comparative modeling; Homology modeling; Extremozymes; Thermophilic enzymes; Archaea

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Computational studies on bergaptol O-methyltransferase from Ammi majus L.: The substrate specificity

Keywords: مدل سازی همگرا; BMT; COMT; Homology modeling;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Bridging the gaps in 3D structure of the inositol 1,4,5-trisphosphate receptor-binding core

Keywords: مدل سازی همگرا; Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor; Homology modeling; Ca2+ binding; Ca2+ release

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Molecular modeling of the non-covalent binding of the dietary tomato carotenoids lycopene and lycophyll, and selected oxidative metabolites with 5-lipoxygenase

Keywords: مدل سازی همگرا; 5-HETE; 5-oxo-EET; 5-Lipoxygenase; 5-LOX; Astaxanthin; Blind docking; Homology modeling; Lycopene; Lycophyll; Oxidative metabolites

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Prediction of the mechanism of action of omuralide (clasto-lactacystin β-lactone) on human cathepsin A based on a structural model of the yeast proteasome β5/PRE2-subunit/omuralide complex

Keywords: مدل سازی همگرا; Cathepsin A; Proteasome; Chymostatin; Lactacystin; Omuralide; Homology modeling;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Structure determinants and substrate recognition of serine carboxypeptidase-like acyltransferases from plant secondary metabolism

Keywords: مدل سازی همگرا; SMT, 1-O-sinapoyl-β-glucose:l-malate sinapoyltransferase; SCT, 1-O-sinapoyl-β-glucose:choline sinapoyltransferase; SCP, serine carboxypeptidaseArabidopsis; Homology modeling; Serine carboxypeptidases; Acyltransferases; Phenylpropanoid metabolism; Molecula

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Essential structural profile of a dual functional inhibitor against cyclooxygenase-2 (COX-2) and 5-lipoxygenase (5-LOX): Molecular docking and 3D-QSAR analyses on DHDMBF analogues

Keywords: مدل سازی همگرا; COX-2; 5-LOX; Dual inhibitor; NSAIDs; DHDMBF; Homology modeling; Docking; 3D-QSAR; CoMFA; CoMSIA

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Homology modeling of human sialidase enzymes NEU1, NEU3 and NEU4 based on the crystal structure of NEU2: Hints for the design of selective NEU3 inhibitors

Keywords: مدل سازی همگرا; Homology modeling; Comparative modeling; Sialidase (neuraminidase); Structure-based inhibitor design; Molecular electrostatic potential (MEP); Active site modeling

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Computational prediction of homodimerization of the A3 adenosine receptor

Keywords: مدل سازی همگرا; GPCRs; Purine receptors; Rhodopsin; Homology modeling; Protein–protein docking

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Structures of Ubiquitin Insertion Mutants Support Site-specific Reflex Response to Insertions Hypothesis

Keywords: مدل سازی همگرا; indels; homology modeling; protein engineering; crystallography; ubiquitinNCS, non-crystallographic symmetry

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Structural Evidence for Adaptive Ligand Binding of Glycolipid Transfer Protein

Keywords: مدل سازی همگرا; crystal structure; homology modeling; conformational change; cavity; fluorescenceGLTP, glycolipid transfer protein; rGLTP, recombinant GLTP; MIR, multiple isomorphous replacement; NEM, N-ethylmaleimide

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Predicting 3D structures of transient protein–protein complexes by homology

Keywords: مدل سازی همگرا; Protein–protein complex; Homology modeling; Structural superimposition; Domain structure; Sequence similarity; Structure prediction

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 14 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Refinement of Protein Structures by Iterative Comparative Modeling and CryoEM Density Fitting

Keywords: مدل سازی همگرا; protein structure prediction; comparative modeling; homology modeling; cryo-electron-microscopy; density fittingcryoEM, cryo-electron microscopy; RDV, rice dwarf virus; BDV, bluetongue virus; RMSD, root-mean-square deviation

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 14 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Computational approaches to modeling drug transporters

Keywords: مدل سازی همگرا; Homology modeling; 3D-QSAR; Pharmacophore; Transporter

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 14 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

New insights about HERG blockade obtained from protein modeling, potential energy mapping, and docking studies

Keywords: مدل سازی همگرا; HERG potassium channel; HERG blockers; Homology modeling; Induced fit; Terfenadine; MK-499; Cisapride; Sertindole; Clofilium; Ibutilide

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 14 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

Docking studies of agonists and antagonists suggest an activation pathway of the A3 adenosine receptor

Keywords: مدل سازی همگرا; Purines; G-protein-coupled receptor; Homology modeling; 7TM receptor; Binding site; Nucleoside

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 16 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه

(28) Structural insights into AChE inhibition by monoclonal antibodies

Keywords: مدل سازی همگرا; AChE; acetylcholinesterase (BgAChE, from Bungarus fasciatus; EeAChE, from Electrophorus electricus; mAChE; from mouse); CDR; complementarity determining region; Fab; mAb fragment; Fv; variable mAb fragment; IC50; inhibitor concentration at 50% activity; m

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2005 سفارش ترجمه

Core deformations in protein families: a physical perspective

Keywords: مدل سازی همگرا; Homology modeling; Normal mode analysis; Protein evolution;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2005 سفارش ترجمه

Theoretical study on 3-hydroxykynurenine transaminase by homology modeling and molecular dynamics

Keywords: مدل سازی همگرا; 3-Hydroxykynurenine transaminase; Docking; Homology modeling;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2005 سفارش ترجمه

Three dimensional structural studies of α-N-acetylgalactosaminidase (α-NAGA) in α-NAGA deficiency (Kanzaki disease): different gene mutations cause peculiar structural changes in α-NAGAs resulting in different substrate specificities and clinical phen

Keywords: مدل سازی همگرا; α-N-acetylgalactosaminidase deficiency; Kanzaki disease; Homology modeling;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2005 سفارش ترجمه