دانلود مقالات ISI درباره شبیه سازی پویایی مولکولی + ترجمه فارسی

Effect of C60 adducts on the dynamic structure of aromatic solvation shells

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Fullerenes; Solubility; Molecular dynamics simulations; Structure analysis;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 19 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

BMP-2 and BMP-9 binding specificities with ALK-3 in aqueous solution with dynamics

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Bone morphogenetic proteins; Activin receptor-like kinases; Molecular dynamics simulations; Water; Ligand receptor binding; Signaling;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 21 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Functional mapping of the N-terminal arginine cluster and C-terminal acidic residues of Kir6.2 channel fused to a G protein-coupled receptor

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; ACh; acetylcholine; atm; atmosphere; C-ter; C-terminus; CTD; cytoplasmic domain; D2; D2L dopaminergic receptor; GPCR; G protein-coupled receptor; ICCR; ion channel-coupled receptor; N-ter; N-terminus; TEVC; two-electrode voltage-clamp; TMD; transmembrane

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 23 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Molecular dynamics simulation studies of transmembrane transport of chemical components in Chinese herbs and the function of platycodin D in a biological membrane

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Platycodin D; Biomembrane fluidity; Molecular dynamics simulations; Dipalmitoylphosphatidylcholine bilayer; Transmembrane transport;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 24 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Rational design for the stability improvement of Armillariella tabescens β-mannanase MAN47 based on N-glycosylation modification

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; N-glycosylation; Posttranslational modification; Homology modeling; Enzyme stability; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 24 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Solubility profiles, hydration and desolvation of curcumin complexed with γ-cyclodextrin and hydroxypropyl-γ-cyclodextrin

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Curcumin; Cyclodextrins; Complex stability; Hydrated molecular docking; Hydrogen bonds; Monte Carlo; Molecular dynamics simulations; Free energy calculations; GDSRMADSINPKSL-HSEONFRVSA-N; ZIUSSTSXXLLKKK-KOBPDPAPSA-N; KOIVRVKLZWBANP-JSNPPQGDSA-N;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 25 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Molecular dynamics simulations on the heterocyclic cyclodecapeptide and its linear analogous in water and octanol solvents

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Cyclic peptide; Linear peptide; Diffusion coefficient; Solvent; Molecular dynamics simulations; Radial distribution function; Hydrophobic accessible surface;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 27 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Lattice thermal conductivity of δ-graphyne - A molecular dynamics study

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Thermal conductivity; Carbon structures; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 27 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Spectroscopy analysis and molecular dynamics studies on the binding of penicillin V and sulbactam to beta-lactamase II from Bacillus cereus

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Beta-lactamase II from Bacillus cereus; Penicillin V; Sulbactam; Spectroscopy analysis; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 28 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Modeling of flux, binding and substitution of urea molecules in the urea transporter dvUT

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular modeling; Molecular dynamics simulations; Monte Carlo methods; Membrane proteins; Urea transporter;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 28 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Performance of a docking/molecular dynamics protocol for virtual screening of nutlin-class inhibitors of Mdmx

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; EF; enrichment factor; FP; fluorescence polarization; LIE; linearized interaction energy; MM/PBSA; molecular mechanics/poisson - Boltzmann surface area; NPT; number, pressure-temperature; NTD; N-terminal transactivation domain; RMSD; root mean square de

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 28 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Molecular dynamics investigation of the elastic and fracture properties of the R-graphyne under uniaxial tension

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; R-graphyne; Elastic properties; Fracture properties; Chirality;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 30 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Computational analysis of Amsacrine resistance in human topoisomerase II alpha mutants (R487K and E571K) using homology modeling, docking and all-atom molecular dynamics simulation in explicit solvent

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Topoisomerase II α; Amsacrine; Drug resistance; Homology modeling; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 30 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

The effect of β-glucan and its potential analog on the structure of Dectin-1 receptor

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Dectin-1; β-glucan; Molecular dynamics simulations; Molecular docking; Principle component analysis; Loop shift model;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 31 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Structure-function studies of BPP-BrachyNH2 and synthetic analogues thereof with Angiotensin I-Converting Enzyme

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Docking; Molecular dynamics simulations; Molecular mechanics Poisson-Boltzmann surface area; g_mmpbsa; proline-Rich oligopeptide; Toxicological prediction; ACE; Angiotensin-I converting enzyme; ADT; AutoDock Tools; CC50; Mean cytotoxic concentration; IC50

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 33 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Molecular dynamics simulation studies of novel β-lactamase inhibitor

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Molecular docking; Antibiotic resistance; New Delhi metallo-β-lactamase-1 (NDM-1); Multi Drug Resistant Organisms (MDROs);

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 34 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Insights into proton translocation in cbb3 oxidase from MD simulations

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; pKa calculations; Proton transfer; Water dynamics; Cytochrome c oxidase; Proton pump; Membrane protein;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 35 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

A combined EPR and MD simulation study of a nitroxyl spin label with restricted internal mobility sensitive to protein dynamics

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; EPR spectroscopy; Spin labels; Molecular dynamics simulations; MTSL; Protein dynamics;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 35 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Structural dynamics of wild type and mutated forms of human L1 endonuclease and insights into its sequence specific nucleic acid binding mechanism: A molecular dynamics study

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; LINE-1; Endonuclease; Ribonucleoprotein complex; DNA bending;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 39 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Substrate temperature and ion kinetic energy effects on first steps of He+ implantation in tungsten: Experiments and simulations

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Tungsten; Helium; Implantation/Irradiation; Molecular dynamics simulations; Vacancy generation;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 45 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Structure and transport at grain boundaries in polycrystalline olivine: An atomic-scale perspective

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Classical force field; Polycrystalline olivine; Grain boundaries; Pair distribution functions; Self-diffusion coefficients; Viscosity; Electrical conductivity;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 51 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Intrinsic structural transitions of the pyramidal I 〈c + a〉 dislocation in magnesium

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Magnesium; Dislocations; Plasticity; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Atomistic simulation of nanoindentation on incipient plasticity and dislocation evolution in γ/γ′ phase with interface and void

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Nanoindentation; Molecular dynamics simulations; Misfit dislocation; Void;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Damage accumulation in ion-irradiated Ni-based concentrated solid-solution alloys

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Ion irradiation; Concentrated solid-solution alloys; Ni-based alloys; Defect cluster; Frenkel pair;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Structural and thermal properties of Cd-Zn-Te ternary nanoparticles: Molecular-dynamics simulations

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Nanoparticles; CdZnTe; Molecular dynamics simulations; Heat capacity; Bond order potential (BOP); Order parameter;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Advantages of Ge anode for Na-ion batteries: Ge vs. Si and Sn

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Na-ion battery; Energy storage materials; Amorphization; Electrochemical reactions; Ionic conduction; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Exploring the membrane fusion mechanism through force-induced disassembly of HIV-1 six-helix bundle

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Six-helix bundle; Protein unfolding; Molecular dynamics simulations; Interfacial interaction; Membrane fusion; MD; molecular dynamics; SMD; steered molecular dynamics; 6HB; six-helix bundle; NHR/CHR; N/C-terminal heptad repeat; RMSD; root-mean-square devi

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Theoretical investigation of exchange of N2 and H2 in sII clathrate hydrates

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Replacement; Clathrate hydrate; Ab initio calculations; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Probing the binding of Cu2 + ions to a fragment of the Aβ(1-42) polypeptide using fluorescence spectroscopy, isothermal titration calorimetry and molecular dynamics simulations

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Aβ(1-42) fragments; Fluorescence quenching; Metal-peptide binding; Isothermal titration calorimetry; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Polyethyleneimine loaded inverse SDS micelle in pentanol/toluene media

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; SDS inverse micelle; Polyethyleneimine; Molecular dynamics simulations; Microemulsions;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Electro-coalescence of two charged droplets under constant and pulsed DC electric fields

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Electro-coalescence; Charged droplets; Molecular dynamics simulations; DC electric field; Pulsed DC electric field;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Distribution and dynamics of quinones in the lipid bilayer mimicking the inner membrane of mitochondria

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; MD; molecular dynamics; US; umbrella sampling; WHAM; weighted histogram analysis method; PMF; potential of mean force; Q; quinone or its analogue; PC; phosphatidylcholine; PE; phosphatidylethanolamine; CL; cardiolipin; Electron transport chain; Molecular

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Study on the differences of Na- and Ca-montmorillonites in crystalline swelling regime through molecular dynamics simulation

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Montmorillonite; Crystalline swelling; Molecular dynamics simulations; Self-diffusion coefficient

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Light scattering and computer simulation studies of superionic pure and La-doped BaF2

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Superionic conductors; Fluorites; Light scattering spectroscopy; Molecular Dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Solvent effects in the thermal decomposition reaction of ammonium carbamate: A computational molecular dynamics study of the relative solubilities of CO2 and NH3 in water, ethylene glycol, and their mixtures

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Carbon dioxide; Ammonia; Ammonium carbamate; Ethylene glycol; Solvent effects; Heat exchanger; Solubility; Volume expansion

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Molecular modeling, mutational analysis and conformational switching in IL27: An in silico structural insight towards AIDS research

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; WT, wild type; MT_G, mutant type with glycine; MT_A, mutant type with alanine; MD, molecular dynamicsIL-27; Molecular modeling; Mutation; Molecular dynamics simulations; AIDS; Biostatistics

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Onset of plasticity and its relation to atomic structure in CuZr metallic glass nanowire: A molecular dynamics study

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Amorphous materials; Metallic glasses; Mechanical properties; Computer simulations; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

A molecular dynamics investigation into the size-dependent buckling behavior of a novel three-dimensional metallic carbon nanostructure (T6)

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Three-dimensional metallic carbon; Buckling; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Formation of single carbon chain bridging two SWCNTs via tensile deformation of nanobud junction

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Carbon nanotube; Molecular junction; Single carbon atom chain; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

The local structure of Fe in Li(Al, Fe)Si2O6 glasses from molecular dynamics simulations

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Lithium alumino-silicate glasses; Fe incorporation; molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Improved prediction of bilayer and monolayer properties using a refined BMW-MARTINI force field

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Coarse-grained models; Lipid; Bilayer; Monolayer; BMW-Martini;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Exploring new scaffolds for angiotensin II receptor antagonism

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Angiotensin II receptor antagonists; Pharmacophore modeling; Virtual screening; Pharmacological characterization; Molecular Dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Membrane and inhibitor interactions of intracellular phospholipases A2

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Phospholipase A2; PAPC; Catalytic cycle; Allosteric regulation; Eicosanoid pathway; Molecular dynamics simulations; DXMS;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Structure â¿¿ membrane activity relationship in a family of peptide-based gemini amphiphiles: An insight from experimental and theoretical model systems

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Gemini surfactant; Peptide; Molecular dynamics simulations; Biomembrane;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Reversed Hofmeister series—The rule rather than the exception

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Hofmeister series; Reversal; Surface charge; Salt concentration; Hydrophobicity; pH; Poisson–Boltzmann theory; Molecular dynamics simulations; AFM

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Tension-compression asymmetry in uniaxial deformation of a magnesium bicrystal with [1¯100] symmetric tilt grain boundary

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Grain boundaries; Uniaxial deformation; Magnesium; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Molecular dynamics simulations of nanoporous organosilicate glasses using Reactive Force Field (ReaxFF)

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Reactive Force Field; Nanoporous silica; Organosilicate glass; Mechanical properties

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Structure binding relationship of human surfactant protein D and various lipopolysaccharide inner core structures

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Surfactant protein D; D324N + D325N + R343K mutant; Carbohydrate recognition domain; Lipopolysaccharide inner core structure; Gram-negative bacteria; Glycan array; Surface plasmon resonance; Molecular docking; Molecular dynamics simulations; Synthetic

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Molecular simulations of lactose-bound and unbound forms of the FaeG adhesin reveal critical amino acids involved in sugar binding

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; FaeG adhesin; Lectin; Lactose; Sugar binding; Epithelial; Mutation;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Molecular dynamics simulations of ternary PtxPdyAuz fuel cell nanocatalyst growth

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Ternary nanocatalyst; PEMFC; Fuel cell electrode; Core-shell; Alloy;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه