دانلود مقالات ISI درباره شبیه سازی پویایی مولکولی + ترجمه فارسی

Surface-induced vacancy loops and damage dispersion in irradiated Fe thin films

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Ion irradiation; In situ transmission electron microscopy; Defects; Microstructure;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Vienna Soil-Organic-Matter Modeler-Generating condensed-phase models of humic substances

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Soil-Organic-Matter (SOM); Humic substances; Natural organic matter (NOM); Molecular models; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

A novel fragment based strategy for membrane active antimicrobials against MRSA

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Membrane active antimicrobials; Molecular dynamics simulations; Fragment based drug design; Pharmacophore model;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

The binding of small carbazole derivative (P7C3) to protofibrils of the Alzheimer's disease and β-secretase: Molecular dynamics simulation studies

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Alzheimer's disease; Amyloid β aggregates; β-Secretase; Molecular dynamics simulations; P7C3;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

β-cyclodextrin hinders PLGA plasticization during microparticle manufacturing

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Ketoprofen; β-cyclodextrin; Poly(lactide-co-glycolide); Plasticizing effect; Microparticles; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Novel serine-based gemini surfactants as chemical permeation enhancers of local anesthetics: A comprehensive study on structure-activity relationships, molecular dynamics and dermal delivery

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Dermal drug delivery; Chemical permeation enhancers; Tetracaine; Ropivacaine; Serinebased surfactants; Molecular dynamics simulations; ACN; acetonitrile; CD; cyclodextrin; CMC; critical micelle concentration; CPE; chemical permeation enhancer; DMEM; Dulbe

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Characterizing the conformational dynamics of metal-free PsaA using molecular dynamics simulations and electron paramagnetic resonance spectroscopy

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Cluster A-I solute-binding protein (SBP); Streptococcus pneumoniae; PsaA; Molecular dynamics simulations; Electron paramagnetic resonance (EPR) spectroscopy; Protein flexibility; Spin-label mobility;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Recognition of multiepitope dendrimeric antigens by human immunoglobulin E

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; AXO; amoxicilloyl; BPO; benzylpenicilloyl; DeAn; dendrimeric antigens; ENDA; European Network of Drug Allergy; MDM; minor determinants mixture; MDS; molecular dynamics simulations; PPL; poly-l-lysine; RAST; RadioAllergoSorbent; Immune response; Immunochem

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Extension of the free energy workflow FEW towards implicit solvent/implicit membrane MM-PBSA calculations

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; AMBER; Molecular dynamics simulations; Ion channel; Membrane protein; Drug design;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

A theoretical view of the C3d:CR2 binding controversy

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; C3d; complement fragment 3d; CR2; complement receptor 2; SCR; short consensus repeat; PDB; protein data bank; MD; molecular dynamics; SASA; solvent-accessible surface area; SMD; steered molecular dynamics; AESOP; analysis of electrostatic similarities of

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Membrane association of the PTEN tumor suppressor: Neutron scattering and MD simulations reveal the structure of protein-membrane complexes

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; PTEN; Protein-membrane complex; Phosphatidylinositolphosphate; Phosphatidylserine; Neutron reflection; Tethered bilayer lipid membranes; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

What can we learn from molecular dynamics simulations for GPCR drug design?

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; GPCR; Homology modeling; Water network; CC chemokine receptor 3; Muscarinic acetylcholine receptor 3

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

A salt-bridge stabilized C-terminal hook is critical for the dimerization of a Bowman Birk inhibitor

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Knob-in-the-hole; Site-directed mutagenesis; Molecular dynamics simulations; Salt bridge; Substrate-induced monomerisation; Trypsin/chymotrypsin inhibitor

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Molecular modeling studies of [6,6,5] Tricyclic Fused Oxazolidinones as FXa inhibitors using 3D-QSAR, Topomer CoMFA, molecular docking and molecular dynamics simulations

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; FXa; Tricyclic Fused Oxazolidinones; Topomer CoMFA; 3D-QSAR; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Experimental determination and computational interpretation of biophysical properties of lipid bilayers enriched by cholesteryl hemisuccinate

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Time-dependent fluorescence shift; Molecular dynamics simulations; Cholesterol-mimicking detergents; Laurdan; DPH; Dynamic light scattering;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Imidacloprid and thiacloprid neonicotinoids bind more favourably to cockroach than to honeybee α6 nicotinic acetylcholine receptor: Insights from computational studies

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; nAChR; nicotinic acetylcholine receptor; Ac-AChBP; Aplysia californica-acetylcholine binding protein; LGICs; ligand-gated ion channels; GABA; gamma-aminobutyric acid; 5-HT3; 5-hydroxytryptamine receptor subtype 3; CHARMM; Chemistry at Harvard Molecular Me

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Human PD-1 binds differently to its human ligands: A comprehensive modeling study

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; PD1; PD-L1; PD-L2; Protein-Protein docking; ZDOCK; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Molecular dynamics methods to predict peptide locations in membranes: LAH4 as a stringent test case

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; PMF; potential of mean force; AA; all-atom; CG; coarse-grained; MD; molecular dynamics; CPP; cell-penetrating peptide; FF; force-field; ATR-FTIR; attenuated total reflection Fourier-transform IR; OCD; oriented circular dichroism; TM; transmembrane; LAH4-c

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Discovery of potent and selective urea-based ROCK inhibitors: Exploring the inhibitor's potency and ROCK2/PKA selectivity by 3D-QSAR, molecular docking and molecular dynamics simulations

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; ROCK inhibitors; ROCK/PKA selectivity; 3D-QSAR; Molecular docking; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

In silico approaches for the identification of virulence candidates amongst hypothetical proteins of Mycoplasma pneumoniae 309

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Hypothetical proteins; Mycoplasma pneumoniae; Function predictions; Sequence analyses; Virulence factors; Molecular dynamics Simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 14 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Conformational dynamics of bacterial and human cytoplasmic models of the ribosomal A-site

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Ribosomal RNA; Bacterial A-site; Human cytoplasmic A-site; Molecular dynamics simulations; Aminoglycoside antibiotics;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 15 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Mutational mapping of the transmembrane binding site of the G-protein coupled receptor TGR5 and binding mode prediction of TGR5 agonists

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; 7-Helix receptor; Cyclic AMP; Quantitative structure activity relationship; Structure model; Molecular dynamics simulations; Molecular docking;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 16 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

New mimetic peptides inhibitors of Αβ aggregation. Molecular guidance for rational drug design

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular modelling; Amyloid β-protein; Mimetic peptides; Aggregation modulating effect; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 17 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Numerical study of hetero-adsorption and diffusion on (100) and (110) surfaces of Cu, Ag and Au

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Adatom diffusion; Copper; Silver; Gold; Embedded atom potential; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 18 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Identification of chikungunya virus nsP2 protease inhibitors using structure-base approaches

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Nsp2 protease; Chikungunya virus; Structure-based approaches; Molecular docking; Virtual screening; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 21 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Conformational variation of an extreme drug resistant mutant of HIV protease

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; HIV-1 protease; Drug resistance mutations; Flap dynamics; Resistance mechanisms; X-ray crystallography; Molecular dynamics simulations; Coordinated motions;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 37 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Bolaamphiphiles as carriers for siRNA delivery: From chemical syntheses to practical applications

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Bolaamphiphiles; Molecular dynamics simulations; Cryo-EM; FRET; siRNA drug delivery; RNAi induced gene silencing;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 38 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Surface molecular imprinting on hybrid SiO2-coated CdTe nanocrystals for selective optosensing of bisphenol A and its optimal design

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; APTES; 3-aminopropyltriethoxysilane; CL; cross-linker; FL; fluorescence; HPLC; High Performance Liquid Chromatography; HS-QD@MIP; molecular imprinted polymer capped hybrid SiO2-coated Nanocrystals; MD; molecular dynamics; NaBH4; Sodium borohydride; NCs; N

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 50 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Atomistic simulation of irradiation effects in GaN nanowires

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Nanowires; Irradiation effects; Mechanical properties

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Self-consistent-charge density-functional tight-binding molecular dynamics simulations of amorphous TiO2 growth

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Amorphous titania growth; Collision-induced reaction; Density-functional tight-binding method; Titanium-oxide cluster deposition;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Molecular dynamics computation of the dynamical structure factor of a Lennard–Jones glass: Propagation of acoustic modes at the nm-scale

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Amorphous materials; Metallic glasses; Acoustic properties; Mechanical properties; Phonons; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Trapping of oxide ions in δ-Bi3YO6

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Bismuth oxide; Bismuth yttrium oxide; Fluorite structure, DFT calculations; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 5 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Simulation of nitrogen diffusion in Ni vis-à-vis Fe – Identification of better structural material for neutron detectors

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Inconel 600; Austenitic stainless steel; Nitrogen diffusion; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 5 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Ab initio and classical molecular dynamics simulations of N2 desorption from TiN(001) surfaces

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; N2 desorption; Surface diffusion; Nitrides; Molecular dynamics simulations; Density functional theory; Vacancy formation;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Molecular dynamics simulations on inclusion complexes for chiral enantiomers with heterocyclic cyclodecapeptide

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Cyclopeptide; Host; Guest; Molecular recognition; Inclusion complex; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Unraveling the binding mechanism of polyoxyethylene sorbitan esters with bovine serum albumin: A novel theoretical model based on molecular dynamic simulations

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Non-ionic surfactants; BSA; Tween; Polysorbates; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Testing synthetic amyloid-β aggregation inhibitor using single molecule atomic force spectroscopy

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Single molecule force spectroscopy; Amyloid-β aggregation; Fibril formation; Aggregation inhibitor; Molecular dynamics simulations; Alzheimer's disease;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

P-I class metalloproteinase from Bothrops moojeni venom is a post-proline cleaving peptidase with kininogenase activity: Insights into substrate selectivity and kinetic behavior

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Snake venom metalloproteinase; Kininogenase activity; FRET peptides; Substrate specificity; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Ti adatom diffusion on TiN(001): Ab initio and classical molecular dynamics simulations

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Surface diffusion; Nitrides; Molecular dynamics simulations; Density functional theory;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Binding phenomena and fluorescence quenching. II: Photophysics of aromatic residues and dependence of fluorescence spectra on protein conformation

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Protein; Tryptophan; Fluorescence; Quenching; Electron transfer; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Grape anthocyanin oligomerization: A putative mechanism for red color stabilization?

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Malvidin-3-O-glucoside trimer; Ionization reactions; Hydration; Stacking; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Identification, pharmacological evaluation and binding mode analysis of novel chromene and chromane based σ1 receptor ligands

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular interactions; σ1 receptor ligands; Structure affinity relationships; Docking studies; Molecular dynamics simulations; Binding pose

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Molecular dynamics simulations for the growth of CH4-CO2 mixed hydrate

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; molecular dynamics simulations; methane-carbon dioxide mixed hydrate; growth; clathrate

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Correlation of biological activity with computationally derived structural features from transmembrane hetero-dimers of HIV-1 Vpu with host factors

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Vpu HIV-1; Membrane protein; Host factors; Molecular dynamics simulations; Docking approach;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Simulations of monomeric amyloid β-peptide (1–40) with varying solution conditions and oxidation state of Met35: Implications for aggregation

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Modeling; Protein folding; Amyloid-β; Methionine oxidation

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Role of oxygen on the interfacial adsorption sites of Lu and La in β-Si3N4

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Rare earths; Intergranular films; Adsorption

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Molecular dynamics simulations on scattering of single Ar, N2, and CO2 molecules on realistic surfaces

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Gas-surface scattering; Molecular dynamics simulations; Tangential momentum accommodation coefficient (TMAC); Scattered angular distribution; Rarefied gas flow

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

How do the protonation states of E296 and D312 in OmpF and D299 and D315 in homologous OmpC affect protein structure and dynamics? Simulation studies

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; OmpC, Outer membrane protein C; OmpF, Outer membrane protein F; MD, Molecular dynamicsOmpC; OmpF; Outer membrane protein; Porin; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Molecular dynamics study on conformational differences between dGMP and 8-oxo-dGMP: Effects of metal ions

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Mononucleotide; Molecular dynamics simulations; 8-oxo-dGTP; Divalent ion; Nucleotide-sanitizing enzyme; Conformation

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Molecular dynamics simulations of mutated Mycobacterium tuberculosisl-alanine dehydrogenase to illuminate the role of key residues

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Mycobacterium tuberculosis; l-Alanine dehydrogenase; Essential dynamics analysis; Molecular dynamics simulations; Mutated residues

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه